Η Πόλη του Σαν Ντιέγκο αναγνωρίζει επίσημα 109 γειτονιές, καθένα με διακριτικό χαρακτήρα, ιστορία και μικροκλίμα. Μερικές από τις πιο γνωστές περιλαμβάνουν:
Οι εσωτερικές γειτονιές όπως το Νορθ Πάρκ (τέχνες, μπύρα τέχνης), Саут Πάρκ (ιστορικά σπίτια), Χίλκρεστ (κέντρο LGBTQ+), Πανεπιστημιακή Πόλη (εμπορικό κέντρο UTC, βιοτεχνολογία), και Μίρα Μέσα (ποικίλη, οικογενειακή) δείχνουν την αστική ποικιλία του Σαν Ντιέγκο.
Τα όρια γειτονιών χρησιμοποιούνται για σχεδιασμό, αστυνομία και ταυτότητα κοινότητας—αλλά πολλοί κάτοικοι ταυτίζονται περισσότερο με ευρύτερες περιοχές (π.χ., «Βόρεια Κράτηση», «Ανατολική Κράτηση», «Κέντρο Πόλης»).