Η Μίσιγαν έχει ευρύ φάσμα θαλάσσιων habitats, από τις ακτές της Λίμνης Μίσιγαν έως μικρότερες λίμνες και ποταμούς της πολιτείας. Χιλιάδες είδη ζώων κάνουν τη Μίσιγαν το σπίτι τους, και αν και όχι όλα αυτά τα φτωχά μπορεί να είναι θαλάσσια ζωή, πολλά από αυτά εξαρτώνται από τη θαλάσσια ζωή για φαγητό. Υπάρχουν επίσης πολλά θαλάσσια φτωχά στη Μίσιγαν που είναι απειλούμενα ή αντιμετωπίζουν κίνδυνο εξαφάνισης.
Με ένα σώμα νερού τόσο μεγάλο όσο η Λίμνη Μίσιγαν να καλεί σπίτι, δεν είναι έκπληξη ότι υπάρχουν αμέτρητα ψάρια κατά μήκος των ακτών της Μίσιγαν. Μικρά ψάρια όπως το Alewife, Bloater, Brook trout και Freshwater Drum έχουν βρεθεί στη Λίμνη Μίσιγαν. Η λίμνη είναι επίσης σπίτι για μεγαλύτερα ψάρια όπως το Rainbow Trout, Northern Pike, Muskellunge και Lake Sturgeon.
Υπάρχει ευρύ φάσμα μυδιών που βρίσκονται στα νερά της Μίσιγαν. Slippershells, Elktoes, Snuffboxes, Scaleshells και Round pigtoes έχουν παρατηρηθεί στη Μίσιγαν. Άλλα συνηθισμένα μύδια στην πολιτεία περιλαμβάνουν Clubshells, Lake floaters, Purple lilliputs, Deertoes και Ellipses. Τα μύδια είναι γνωστά για τα σχετικά σκληρά εξωτερικά τους αλλά ορισμένες ποικιλίες μπορούν να φαγοβρωθούν.
Οι περισσότεροι άνθρωποι συνδέουν τα μύδια με την παραλία ή τον ωκεανό, αλλά υπάρχουν πολλά μύδια που κάνουν το γλυκύ νερό το σπίτι τους. Μερικά από αυτά τα μύδια βρήκαν τον δρόμο τους στη Μίσιγαν είτε πιάνοντας ένα lift σε ένα πλοίο είτε πηγαίνοντας ποταμούς μέχρι να τελειώσουν στην πολιτεία. Συνηθισμένα μύδια της Μίσιγαν περιλαμβάνουν το μεγαλύτερο ευρωπαϊκό μύδι φακού, μύδι νυχιού ποταμού, στρογγυλό peaclam και γιγάντιο βόρειο Peaclam.
Τα αμφίβια ζουν και στο νερό και στην ξηρά, και πρέπει να χωρίσουν τη ζωή τους μεταξύ των δύο περιβαλλόντων. Η Μίσιγαν φιλοξενεί αρκετά απειλούμενα είδη αμφιβίων όπως η φρύγος κρίκετ του Blanchard, η βόρεια φρύγος λεοπάρδαλη, τα δυτικά μικρότερα σιρήνες και η βορειά φρύγος χορού. Μπορείτε επίσης να περιμένετε να συναντήσετε σαλαμάνδρες Marbled και Smallmouth.
