Η νοτιοανατολική περιοχή της Αλάσκα στην οποία βρίσκεται η Τζούνεο έχει μερικούς από τους υψηλότερους ετήσιους υγρασίες στην πολιτεία της Αλάσκα. Παρά την αφθονή βροχόπτωση, ο τουρισμός είναι ακόμα σημαντικός συνεισφέρων στην τοπική οικονομία.
Σύμφωνα με το National Climatic Data Center, η μέση μηνιαία βροχόπτωση στην Τζούνεο είναι 4,86 ίντσες. Υπάρχουν μέσο όρο 225,9 μέρες βροχής ετησίως, με τα μηνιά της άνοιξης να είναι τα πιο ξερά και τα μηνιά του φθινοπώρου τα πιο υγρά. Απρίλιος είναι ο πιο ξερός μήνας, με 2,96 ίντσες βροχόπτωσης, και Οκτώβριος ο πιο υγρός μήνας, με 8,30.
Το Alaska Climate Research Center σημειώνει ότι το κλίμα γύρω από την Τζούνεο είναι σχετικά ήπιο σε σύγκριση με άλλες περιοχές της Αλάσκα: οι χειμώνες είναι ζεστοί και τα καλοκαίρια δροσερά λόγω μεγαλύτερου μέρους της επιρροής του Ειρηνικού Ωκεανού. Το σύστημα κλαссификации κλίματος Köppen-Geiger χαρακτηρίζει την Τζούνεο ως υγρό ηπειρωτικό κλίμα.
Η άλλη σημαντική μορφή βροχόπτωσης στην Τζούνεο είναι χιονοπτωση. Σύμφωνα με το National Climatic Data Center, η μέση μηνιαία χιονοπτωση στην Τζούνεο είναι 84,1 ίντσες, το ισοδύναμο 8,4 ίντζες βροχής. Χιονοπτωση συμβαίνει κυρίως Νοέμβριο έως Μάρτιο. Ιανουάριος έχει την υψηλότερη μέση χιονοπτωση: 25,4 ίντσες, ή 2,5 ίντζες βροχής.
