Ο ποτάμιος Σέιγεν είναι ο μακρύτερος ποτάμιος που βρίσκεται εξ ολοκλήρου εντός του Νότντακοτα, εκτείνεται περίπου 275 μίλια (443 χλμ) στην ανατολική μερίδα της πολιτείας. Πηγάζει κοντά στο Γουάρικ στο Νομό Μπένσον και ρέει γενικά νοτιοανατολικά, στρίβοντας μέσα από τους νόμους Ράμσεϊ, Έντυ, Φώστερ, Γκρίγκς και Τραϊλ. Ο ποτάμιος ενώνεται τελικά με τον Ερυθρό Ποτάμιο του Βορρά κοντά στο Φάργκο στον Νομό Κασ.
Τροφοδοτούμενος κυρίως από χιονόνερο και βροχή, ο Σέιγεν απορροφά λεκάνη περίπου 10.000 τετραγωνικών μιλίων. Η ροή του είναι ιδιαίτερα εποχιακή, με αυξημένο κίνδυνο πλημμυρών την άνοιξη και το καλοκαίρι. Ο ποτάμιος είναι ζωτικός πόρος νερού για την περιοχή, υποστηρίζοντας γεωργία, αναψυχή και δημαρχιακές υποδομές.