Υπάρχουν πέντε αεροδρόμια εντός 80 μίλια από το Merced, California. Τα πιο κοντινά τρία βρίσκονται εντός οκτώ μίλια από το κέντρο του Merced και δεν εξυπηρετούνται από διεθνείς αεροπορικές. Ωστόσο, ένα προσφέρει συνδεδεμένες πτήσεις σε διεθνές αεροδρόμιο. Τα υπόλοιπα δύο αεροδρόμια βρίσκονται πάνω από 50 μίλια μακριά από το Merced. Αυτά είναι διεθνή αεροδρόμια εξυπηρετούμενα από μεγάλες εμπορικές αεροπορικές.
Το Merced Regional βρίσκεται εκτός Highway 99 στην πόλη Merced. Είναι ένα δημόσια αεροδρόμιο που εξυπηρετεί το Merced και τις περιφερειακές περιοχές. Η Great Lakes Airline είναι η μόνη εμπορική αεροπορική σε λειτουργία στο MCE. Σύμφωνα με μια ανακοίνωση τύπου της πόλης Merced, από την 7 Απριλίου 2010, η Great Lakes θα πετάει δις καθημερινά στο McCarran International Airport στο Las Vegas, Nevada από το οποίο είναι διαθέσιμες άλλες συνδεδεμένες πτήσεις.
Μια πρώην αμερικανική αερική βάση, το Castle Airport βρίσκεται εκτός Highway 99 στην πόλη Atwater, περίπου οκτώ μίλια από το κέντρο του Merced. Το μεγαλύτερο μέρος της αεροπορικής κίνησής του αποτελείται από γενική αεροπορία (αντίθετα με στρατιωτική ή μεγάλες αεροπορικές) και πτήσεις που σχετίζονται με δύο σχολές πτήσης: Sierra Academy of Aeronautics και American School of Aviation.
Το Flying M Ranch είναι ένα ιδιωτικό αεροδρόμιο που βρίσκεται εκτός Highway 99 στο Merced. Απαιτεί άδεια προ του προσγείωσης καθώς δεν προσφέρει μεγάλες εμπορικές αεροπορικές υπηρεσίες.
Το πλησιέστερο μεγάλο διεθνές αεροδρόμιο στο Merced, το Fresno Yosemite International Airport είναι 56 μίλια από το κέντρο του Merced, California, εκτός Highway 180. Το FAT είναι επίσης το πλησιέστερο αεροδρόμιο στο Yosemite National Park. Προσφέρει υπηρεσία από οκτώ εγχώριες και μια Μεξικανή αεροπορική, οι οποίες λειτουργούν εθνικές και διεθνείς πτήσεις. Είναι ανοιχτό μεταξύ 3 π.μ. και 1:30 π.μ. ή μέχρι την τελευταία άφιξη. Περιέχει εστιατόρια, καταστήματα, και βραχυπρόθεσμη και μακροπρόθεσμη στάθμευση.
Το Norman Y. Mineta Airport βρίσκεται στο San Jose, CA, 79 μίλια από το Merced. Είναι προσβάσιμο μέσω τριών μεγάλων αυτοκινητόδρομων· 101, 880 και 87. Προσφέρει σημαντικές αεροπορικές υπηρεσίες που αποτελούνται από απευθείας και συνδεδεμένες εθνικές και διεθνείς πτήσεις 24 ώρες την ημέρα. Χαρακτηρίζεται από εμπορικά και εστιατόρια, βραχυπρόθεσμη και μακροπρόθεσμη στάθμευση και, από το 2010, ένα επεκταμένο οκτάπλο checkpoint ασφαλείας.
