Η λίμνη Βικτώρια βρίσκεται στην ισημερινή περιοχή της Αφρικής, πράγμα που σημαίνει ότι δέχεται πολλές βροχοπτώσεις. Η μέση ετήσια βροχόπτωση είναι περίπου 1.500 mm. Οι πιο υγροί μήνες είναι ο Μάρτιος, ο Απρίλιος και ο Μάιος, όταν η βροχόπτωση μπορεί να φτάσει και τα 300 mm το μήνα. Οι πιο ξηροί μήνες είναι ο Ιανουάριος και ο Φεβρουάριος, όταν η βροχόπτωση μπορεί να φτάσει και τα 50 mm ανά μήνα.
Το κλίμα της λίμνης Βικτώρια είναι ιδανικό για τη γεωργία. Η θερμοκρασία και οι βροχοπτώσεις είναι αρκετά υψηλές για να υποστηρίξουν την ανάπτυξη των καλλιεργειών και το έδαφος είναι γόνιμο. Οι κύριες καλλιέργειες που καλλιεργούνται στην περιοχή είναι οι μπανάνες, ο καλαμπόκι, η μανιόκα και το ρύζι.