Η Πουέρτο Ρίκο εξυπηρετείται από πέντε αεροδρόμια, από ένα μεγάλο διεθνές κέντρο έως μικρότερα περιφερειακά και γενικής αερonautικής εγκαταστάσεις. Εδώ η ανάλυση κάθε ενός:
Τοποθεσία: Καρολίνα, 8 μίλια από το Σαν Χουάν
Ρόλος: Πρωτεύον διεθνές πύλη, πλέον γειτονικό αεροδρόμιο στην Καραϊβική με πάνω από 4 εκατομμύρια επιβάτες ετησίως.
Τοποθεσία: Ισλα Βέρδε, 6 μίλια από το Σαν Χουάν
Ρόλος: Αεροδρόμιο γενικής αερonautικής, εξυπηρετεί ιδιωτικές και чарτέρ πτήσεις.
Τοποθεσία: 7 μίλια από την Αγκουαδίγια, βορειοδυτική Πουέρτο Ρίκο
Ρόλος: Περιφερειακό αεροδρόμιο με φόρτωση και περιορισμένη επιβατική υπηρεσία, πρώην βάση αεροπορίας ΗΠΑ.
Τοποθεσία: Πόνσε, νότια Πουέρτο Ρίκο
Ρόλος: Περιφερειακό αεροδρόμιο που εξυπηρετεί τη νότια ακτή, με μερικές διεθνείς чарτέρ πτήσεις.
Τοποθεσία: Νησί Βιέκες
Ρόλος: Μικρό αεροδρόμιο για γενική αερonautική και εσωτερικές εμπορικές πτήσεις στη Βιέκες.
Το SJU χειρίζεται το μεγαλύτερο μέρος της εμπορικής κίνησης, ενώ τα υπόλοιπα υποστηρίζουν την περιφερειακή συνδεσιμότητα, φόρτωση και γενική αερonautική.