- Luis Muñoz Marín Διεθνές Αεροδρόμιο (SJU): Βρίσκεται στην Καρολίνα, οκτώ μίλια από το San Juan, το SJU είναι το κύριο αεροδρόμιο στο Πουέρτο Ρίκο. Είναι το πιο πολυσύχναστο αεροδρόμιο της Καραϊβικής, με περισσότερα από 4 εκατομμύρια κινήσεις επιβατών κάθε χρόνο.
- José Aponte de la Torre Αεροδρόμιο (RVR): Βρίσκεται στο Isla Verde, έξι μίλια από το San Juan, το RVR είναι ένα μικρό αεροδρόμιο που χρησιμοποιείται για τη γενική αεροπορία.
- Rafael Hernández Αεροδρόμιο (BQN): Βρίσκεται επτά μίλια από το Aguadilla, το BQN είναι ένα περιφερειακό αεροδρόμιο στο βορειοδυτικό Πουέρτο Ρίκο.
- Διεθνές αεροδρόμιο Mercedita (PSE): Βρίσκεται στο Ponce, το PSE είναι ένα περιφερειακό αεροδρόμιο στο νότιο Πουέρτο Ρίκο.
- Αεροδρόμιο Antonio Rivera Rodríguez (VQS): Βρίσκεται στο νησί Vieques, το VQS είναι ένα μικρό αεροδρόμιο που χρησιμοποιείται για γενική αεροπορία και μικρές εμπορικές πτήσεις.