1. Κόστος :Η Αγία Σοφία ήταν ένα απίστευτα ακριβό έργο ακόμη και κατά τη βυζαντινή εποχή και η κατασκευή της απαιτούσε τεράστιους πόρους και ανθρώπινο δυναμικό. Η αναπαραγωγή ενός τόσο φιλόδοξου έργου σε μεγάλη κλίμακα θα ήταν απαγορευτικά δαπανηρή για τις περισσότερες σύγχρονες κοινωνίες.
2. Τεχνολογία :Ενώ οι αρχικοί κατασκευαστές της Αγίας Σοφίας είχαν προηγμένες τεχνικές κατασκευής για την εποχή τους, η σύγχρονη μηχανική έχει εξελιχθεί σημαντικά. Διαφορετικά υλικά, τεχνολογίες και αρχές σχεδιασμού χρησιμοποιούνται πλέον για την επίτευξη σεισμικής αντοχής και δομικής σταθερότητας, που μπορεί να διαφέρουν από τις μεθόδους που χρησιμοποιούνται στην Αγία Σοφία.
3. Σχεδίαση :Η Αγία Σοφία σχεδιάστηκε για τον συγκεκριμένο σκοπό και τη θέση της. Τα μοναδικά σχεδιαστικά του στοιχεία και τα αρχιτεκτονικά του χαρακτηριστικά, όπως ο τεράστιος θόλος, ενδέχεται να μην είναι κατάλληλα ή κατάλληλα για άλλους τύπους κτιρίων ή περιβαλλόντων.
4. Σεισμικές συνθήκες :Η ανθεκτικότητα της Αγίας Σοφίας στις φυσικές καταστροφές σχετίζεται ιδιαίτερα με τη σεισμική δραστηριότητα στην περιοχή όπου χτίστηκε (Κωνσταντινούπολη, η οποία βρίσκεται σε σεισμικά ενεργή ζώνη). Ωστόσο, διαφορετικές τοποθεσίες σε όλο τον κόσμο αντιμετωπίζουν διαφορετικούς φυσικούς κινδύνους και τα κτίρια πρέπει να σχεδιάζονται έτσι ώστε να αντέχουν τους συγκεκριμένους κινδύνους και τις συνθήκες του αντίστοιχου περιβάλλοντος τους.
Συνοψίζοντας, ενώ η Αγία Σοφία είναι ένα αρχιτεκτονικό θαύμα που παρουσιάζει αξιοσημείωτη αντίσταση στις φυσικές καταστροφές, δεν είναι εφικτό ή πρακτικό να κατασκευαστούν όλα τα κτίρια με τον ίδιο τρόπο. Κάθε δομή απαιτεί προσεκτικές σχεδιαστικές και μηχανικές εκτιμήσεις με βάση διάφορους παράγοντες όπως το κόστος, η τεχνολογία, ο επιδιωκόμενος σκοπός και οι κίνδυνοι που σχετίζονται με την τοποθεσία.