Επίδραση στα είδη φυτών: Το ιγκουάνα της Τζαμάικας είναι ένας διασκορπιστής σπόρων, που βοηθά στη διανομή των σπόρων των φυτών σε ολόκληρο τον βιότοπό του. Χωρίς τα ιγκουάνα, η ποικιλομορφία και η επιβίωση των φυτικών ειδών θα μπορούσαν να τεθούν σε κίνδυνο, διαταράσσοντας ενδεχομένως ολόκληρη την τροφική αλυσίδα.
Επίδραση καταρράκτη στην άγρια ζωή: Η μείωση ή η απουσία φυτικών ειδών λόγω της απώλειας του ιγκουάνα της Τζαμάικας θα μπορούσε να έχει καταρράκτες επιπτώσεις σε άλλα άγρια ζώα που βασίζονται σε αυτά τα φυτά για τροφή και καταφύγιο. Αυτό θα μπορούσε να προκαλέσει μείωση των πληθυσμών άλλων ειδών ή αλλαγή της συμπεριφοράς και της κατανομής τους.
Διαταραχή της δομής του δάσους: Τα ιγκουάνα της Τζαμάικας δημιουργούν θέσεις φωλιάς που χρησιμεύουν ως μικροβιότοποι για άλλους οργανισμούς. Η απουσία τους θα μπορούσε να διαταράξει τη δομή του δάσους, επηρεάζοντας τον τρόπο κατανομής και χρήσης των πόρων από άλλα είδη.
Φτωχή λειτουργία οικοσυστήματος: Οι διάφοροι ρόλοι που παίζει το ιγκουάνα της Τζαμάικα, όπως η διασπορά των σπόρων και ο κύκλος των θρεπτικών συστατικών, συμβάλλουν στη συνολική υγεία και λειτουργία του οικοσυστήματος. Η διακοπή αυτών των λειτουργιών θα μπορούσε να οδηγήσει σε ένα λιγότερο ανθεκτικό και ποικιλόμορφο οικοσύστημα με την πάροδο του χρόνου.
Πιθανή κατάρρευση οικοσυστήματος: Σε ακραία σενάρια, η απώλεια του ιγκουάνα της Τζαμάικα και ο καταρράκτης των επιπτώσεων που προκαλεί θα μπορούσε να οδηγήσει σε κατάρρευση του οικοσυστήματος, οπότε ολόκληρο το οικοσύστημα δεν μπορεί πλέον να συντηρηθεί. Αυτό θα είχε εκτεταμένες συνέπειες για την οικολογία της περιοχής.