Η Φάραγγα Πουέρτο Ρίκο βρίσκεται στον Ατλαντικό Ωκεανό, ~160 χλμ (100 μίλια) βόρεια της Πουέρτο Ρίκο και της Δομινικανής Δημοκρατίας. Σημειώνει το όριο όπου η Βόρεια Αμερική Πιάτα υποχωρεί κάτω από την Καραϊβική Πιάτα.
Σε 8.376 μ (27.480 πτ), το Βάθος Μιλγουόκι είναι το βαθύτερο σημείο του Ατλαντικού—βαθύτερο από οποιαδήποτε φάραγγα εκτός Ειρηνικού. Η φάραγγα εκτείνεται ~800 χλμ (500 μίλια), παράλληλα με τις Μεγάλες Αντίλλες.
Το τεκτονικό της πλαίσιο παράγει σημαντικούς κινδύνους σεισμών και tsunami για τη Πουέρτο Ρίκο, τις Νήσους Τζέρβιρτζιν, και την ανατολική Καραϊβική. Ο σεισμός 1918 M7.3 προκάλεσε θανατηφόρο tsunami· το γεγονός 1787 μπορεί να ξεπέρασε M8.0.