Οι αβιοτικοί παράγοντες περιλαμβάνουν όλα τα μη ζωντανά φυσικά χαρακτηριστικά μέσα σε ένα περιβάλλον. Παραδείγματα αβιοτικών παραγόντων περιλαμβάνουν πράγματα όπως τύπος εδάφους, θερμοκρασία αέρα και την ποσότητα βροχόπτωσης που μια περιοχή λαμβάνει. Τα Florida Keys είναι ένα αρχιπέλαγος 1.700 νησιών από την άκρη της Φλόριντας. Πολλοί αβιοτικοί παράγοντες επηρεάζουν τους κοραλλιογενείς ραφείες και τα νησιά που αποτελούν τα Florida Keys.
Σύμφωνα με το FOSS Web, ένας ιστότοπος μαθήματος επιστήμης, κάθε χρόνο οι πιθανότητες ενός υφετή να χτυπήσει τα Florida Keys είναι μεταξύ 13 έως 16 τοις εκατό. Αυτοί οι βίαιοι καταιγίδες μπορούν να βλάψουν συστήματα κοραλλιών μέσω ισχυρών ανέμων και μεγάλων κυμάτων. Η πιο σοβαρή βλάβη που κάνει ένας υφετής είναι μέσω της ανάκαμψης ιλύσιων που τότε μειώνει την ποσότητα φωτός που μπορεί να φιλτράρει μέσω της στήλης νερού. Τα ιλύσια μπορεί επίσης να καταστραφούν στους κοραλλιογενείς πολύπους και να πνίξουν τους κοραλλιογενείς μέχρι θανάτου.
Πολλοί από τους κοραλλιογενείς ραφείες που βρίσκονται στα Florida Keys είναι ανοχητοί στη θερμοκρασία νερού. Αυτοί οι ραφείες επιβιώνουν λόγω της ροής που παρουσία μέσα στον Κόλπο του Μεξικού και τα Florida Keys. Ροές που παρουσία περιλαμβάνουν την Loop Current και την Florida Current, οι οποίες συγχωνεύονται με τη Gulf Stream. Αυτές οι ροές φέρνουν ζεστό νερό από τη Νότια Αμερική, τα Καραϊβικά και τον Κόλπο της Φλόριντας.
Τα Florida Keys λαμβάνουν αρκετά άμεσο φως ηλίου δεδομένου ότι είναι πλησιέστερα στην ισημερινή από το μεγαλύτερο μέρος των υπόλοιπων Ηνωμένων Πολιτειών. Αυτό το άμεσο φως ηλίου μπορεί να διεισδύσει κάτω στη στήλη νερού έως 80 μέτρα, ή 260 πόδια, και ονομάζεται φωτική ζώνη. Οι κοραλλιογενείς ραφείες μπορούν να επιβιώσουν μόνο σε φωτικές ζώνες.
Η ποιότητα νερού είναι η περιγραφή της κατάστασης του νερού, σύμφωνα με το Florida Keys National Marine Sanctuary. Οι συνθήκες ποιότητας νερού περιλαμβάνουν τα χημικά, φυσικά και βιολογικά χαρακτηριστικά του νερού. Το νερό στα Florida Keys είναι καθαρό και χαμηλό σε θρεπτικά, αζώτο και φώσφορο. Η ποιότητα νερού επηρεάζεται όταν ρύπανση και μόλυνση, όπως η απόβληση από την γη ή τα λύματα, μπαίνουν στο νερό. Αυτή η αλλαγή μπορεί να βλάψει τους εγγενείς κοραλλιογενείς και τα θαλασσόφυτα επειδή άλλα είδη ζώων και φυτών εισέρχονται στο οικοσύστημα. Αυτά τα φυτά και ζώα μπορούν να διώξουν τους κοραλλιογενείς και τα θαλασσόφυτα από την περιοχή.
