Η Μισιόν Σαν Φρανσίσκο ντε Ασίσ, καλύτερα γνωστή ως Μισιόν Dolores, στο Σαν Φρανσίσκο, Καλοφόρνια, εγκαταστάθηκε υπό την κατεύθυνση του Πάπα Αλέξανδρου VI. Το 1493, ο Πάπας δήλωσε ότι ιεραπόστολοι θα ταξιδεύουν με ισπανούς και πορτογαλούς εξερευνητές. Οι ιερείς θα εγκατασταθούν, θα ιδρύσουν μισιόνες και θα καθοδηγήσουν τους ντόπιους για τον Καθολικισμό.
Τις 9 Οκτωβρίου 1776, η Μισιόν Σαν Φρανσίσκο ντε Ασίσ (τότε γνωστή ως Dolores) ιδρύθηκε στις όχθες της Λαγούνας Dolores.
Το χωριό του Αγίου Φραγκίσκου μεγαλώνει γύρω από τη Μισιόν Dolores, αλλά δεν ευδοκίμησε λόγω του κλίματος και της γεωγραφίας της περιοχής.
Η Μισιόν Dolores παρείχε προστασία και πόρους, αλλά οι ντόπιοι λαοί παρέμειναν υπόπτων. Οι ιεραπόστολοι φέραν ασθένειες και ξένους τρόπους ζωής που οι ντόπιοι δεν κατανόησαν.
Η Καλοifornια Gold Rush έφερε περισσότερο από 20.000 νεοεισερχόμενους στην περιοχή, ενισχύοντας την παρόκια της Μισιόν Dolores.
Η Μισιόν Dolores κράτησε τη θέση της κατά το σεισμό του Σαν Φρανσίσκο το 1906, κάνοντάς τη το παλαιότερο κτίριο στην πόλη.