Η απώλεια biotope είναι ένας από τους κύριους οδηγούς της μείωσης βιοποικιλότητας. Κάθε είδος βασίζεται στο μοναδικό του biotope για συγκεκριμένους πόρους επιβίωσης. Όταν τα biotope καταστρέφονται, αυτοί οι πόροι εξαφανίζονται, αναγκάζοντας τα είδη να προσαρμοστούν ή να αντιμετωπίσουν εξαφάνιση.
Η απώλεια biotope μπορεί να διαταράξει ολόκληρα οικοσυστήματα. Για παράδειγμα, η απομάκρυνση δέντρων από ένα δάσος αλλάζει το μικροκλίμα—θερμοκρασία, υγρασία και επίπεδα φωτός—με κασκαδικές επιπτώσεις σε όλους τους οργανισμούς.
Η απώλεια biotope φέρει σημαντικά οικονομικά κόστη. Η αποδασικοποίηση στην Αμαζονία, για παράδειγμα, μπορεί να μειώσει την βροχόπτωση και να προκαλέσει ξηρασία, επηρεάζοντας αρνητικά τη γεωργία και την υδροηλεκτρική ενέργεια, κλειδιά οικονομικά τομείς.
Η απώλεια biotope επιδεινώνει την κλιματική αλλαγή. Όταν τα δάση ξεκαθαρίζονται, τα δέντρα δεν μπορούν πλέον να απορροφώσουν διοξείδιο του άνθρακα, το οποίο απελευθερώνεται στην ατμόσφαιρα, ενισχύοντας το φαινόμενο του θερμοκηπίου.
Συνολικά, η απώλεια biotope έχει σοβαρές αρνητικές συνέπειες για τη βιοποικιλότητα, την υγεία του οικοσυστήματος, την οικονομία και την κλιματική αλλαγή.