Η αμερικανική κυβέρνηση εκδίδει διαβατήρια, απαραίτητα για σχεδόν όλα τα διεθνή ταξίδια. Αν όλα τα έγγραφα είναι σε τάξη, οι περισσότεροι δεν θα έχουν πρόβλημα να αποκτήσουν διαβατήριο αιτούμενοι σε γραφεία διαβατηρίων ή σε ορισμένα ταχυδρομεία. Οι ενότητες 55 και 22 του CFR περιγράφουν περιπτώσεις απόρριψης.
Το Υπουργείο Εξωτερικών μπορεί να απορρίψει αίτηση για ποινικές παραβάσεις. Οποιος αιτούντας έχει ανακρίβει επιταγή ή σύλληψη (συνομοσπονδιακή, πολιτειακή ή τοπική) μπορεί να απορριφθεί. Συνομοσπονδιακή κλήση ή αίτηση έκδοσης ή προσωρινής σύλληψης από ξένη χώρα είναι επίσης λόγος απόρριψης. Ειδικά διατάξεις διέπουν τις απορρίψεις για καταδικασμένους για ναρκωτικά. Καταδικασμένοι για οποιονδήποτε πολιτειακό νόμο για κατασκευή, διανομή ή κατοχή ελεγχόμενης ουσίας ή συνομοσπονδιακό νόμο για εμπόριο ναρκωτικών και λευκόνυμα χρήματα μπορούν να απορριφθούν.
Ένας γονέας που κάνει αίτηση για παιδί μπορεί να απορριφθεί αν το παιδί είναι στη λίστα του Προγράμματος Ειδοποίησης Έκδοσης Διαβατηρίου Παιδιών. Το πρόγραμμα αποτρέπει τη διεθνή αρπαγή γονέων και η λίστα ελέγχεται με όλες τις αιτήσεις ανηλίκων. Πρόσωπα που χρειάζονται υποστηρικτικά τέλη για παιδιά μπορούν επίσης να απορριφθούν. Το ελάχιστο ποσό που προκαλεί απόρριψη ποικίλλει από $2.000 έως $5.000. Οι ανηλίκους κάτω των 18 ετών εκδίδεται διαβατήριο αν έχουν γονική συγκατάθεση, είναι νόμιμα παντρεμένοι ή είναι στο αμερικανικό στρατό. Χωρίς συγκατάθεση ή ειδικές συνθήκες, απορρίπτονται.
Το Υπουργείο Εξωτερικών έχει мандат να βοηθά απρόσφορους υπηκόους στο εξωτερικό σε προβληματικές καταστάσεις, συμπεριλαμβανομένης αναπατρίδας, ιατρικής φροντίδας, φυλάκισης και επείγουσες καταστάσεις. Μπορεί να πληρώσει ιατρικές διαδικασίες, επείγουσα μεταφορά ή να δώσει δάνειο. Αιτούντες που έχουν λάβει τέτοιο δάνειο και έχουν παράλειψεις πληρωμών μπορεί να απορριφθούν.
Το Υπουργείο Εξωτερικών μπορεί να αρνηθεί έκδοση διαβατηρίου για ιατρικούς λόγους. Αν αμερικανικό δικαστήριο έχει κρίνει άτομο ανίκανο ή διατάξει ανάγκαση σε ψυχιατρικό ίδρυμα, μπορεί να απορριφθεί. Η μόνη εξαίρεση είναι αν το άτομο συνοδεύεται από κύριο ή υπεύθυνο για την επιμέλειά του.