Οι κύριοι σιδηροδρομικοί σταθμοί της Amtrak στη Πενσυλβανία βρίσκονται στο Πίτσбург και τη Φιλαδέλφεια. Τα ταξίδια με τρένο γίνονται ταχύτερα και ευκολότερα από ποτέ, με διάφορες υπηρεσίες που συνδέουν την Πενσυλβανία με τη υπόλοιπη ανατολική ακτή. Οι υπηρεσίες Amtrak προσφέρουν επίσης στους επιβάτες μοναδική εγγύς όψη χωρίς την άγχωση της οδήγησης ή το κόστος αεροπορικού εισιτηρίου. Με πολυάριθμες τουριστικές αξιοθέατες όπως πανεπιστήμια, εθνικά πάρκα και η χώρα των Πενσυλβανικών Ολλανδών, οι ταξιδιώτες που επισκέπτονται την πολιτεία έχουν πολλές επιλογές μεταφοράς.
Το Acela Express της Amtrak κυκλοφορεί μεταξύ της Βοστώνης, Νιού Χέβεν, Νέας Υόρκης, Φιλαδέλφειας και Ουάσιγκτον Ντ.Σ. Προσφέρει υπηρεσία ποιότητας σε τακτικά διαστήματα κατά τις ώρες κίνησης πρωί και βράδυ, με ταχύτατα ταξίδια που φτάνουν τα 150 μίλια την ώρα. Ως η μόνη υπηρεσία υψηλών ταχυτήτων στην Αμερική, το Acela είναι επαγγελματικός τρόπος ταξίδι με θέσεις бизнес και πρώτης κατηγορίας (με υπηρεσία σερβιρίσματος στην θέση), δυνατότητα Wi-Fi, συνεδριακά τραπέζια και σιωπηλά βαγόνια. Περίπου τρία εκατομμύρια άνθρωποι κάθε χρόνο χρησιμοποιούν αυτή την υπηρεσία για επιχειρήσεις και διασκέδαση για να φτάσουν σε προορισμούς στην Ατλαντική ακτή.
Η υπηρεσία τρένου Pennsylvanian τρέχει από τη Νέα Υόρκη μέσω Φιλαδέλφειας και τελειώνει στο Πίτσбург. Το ταξίδι διαρκεί λίγο περισσότερο από εννιά ώρες και καλύπτει σχεδόν 450 μίλια πανόραμων αγροτεμαχιών και κυλινδόμενων λόφων. Διανύοντας τα όρη Αλεγέyni και την πενσυλβανική Ολλανδική χώρα, το Pennsylvanian είναι δημοφιλής υπηρεσία που τρέχει ως μέρος της γραμμής Three Rivers από τη Νέα Υόρκη στο Σικάγο. Ο κλάδος του Pennsylvanian τελειώνει εκεί που τα ποτάμια Αλεγέyni, Μονγκαέλα και Οχάγιο συναντώνται. Οι επιβάτες έχουν πρόσβαση σε βαγόνι εστίασης για γεύματα και ποτά, και υπάρχουν θέσεις coach και бизнес.
Το Capitol Limited είναι μια υπηρεσία διαστädtικών τρένων της Amtrak που τρέχει από Ουάσιγκτον Ντ.Σ. μέσω Πίτσбурга και Κливλάνντ πριν φτάσει στο Σικάγο. Καλύπτει περισσότερο από 750 μίλια και διαρκεί περίπου 10 ώρες. Οι επιβάτες έχουν διαθέσιμες καμπίνες ύπνου με δύο ή τέσσερις κρεβάτια. Το τρένο διαθέτει επίσης βαγόνι εστίασης, αίθουσα θέασης και δεσμευμένες θέσεις. Οι ταξιδιώτες θα περάσουν από την κοιλάδα Ποτόμακ και τα όρη Αλεγέyni πριν διαβούν στην Οχάγιο και συνεχίσουν μέσω Σάντουσκυ στα όρια της λίμνης Έρι.
