Το Puerto Rico είναι ένα τροπικό νησί και έχει έναν μεγάλο αριθμό ανθοφόρων φυτών, μερικά από τα οποία έχουν εισαχθεί επίσης σε κήπους στην ηπειρωτική Αμερική. Τα περισσότερα είδη είναι είτε κοινά με τα άλλα νησιά στα Caraïβια είτε έχουν εισαχθεί, αν και κάποια είναι μοναδικά στο νησί.
Το νησί του Puerto Rico βρίσκεται στα Caraïβια, κοντά στην Κούβα και την Hispaniola (το νησί της Αϊτής και της Δομινικανής Δημοκρατίας). Μαζί με δύο μικρότερα νησιά, σχηματίζει το αρχιπέλαγος του Puerto Rico. Το κλίμα είναι τροπικό, αλλά ο ωκεανός μετριάζει τη ζέστη.
Τα πουλιά στο Puerto Rico προέρχονται κυρίως από τη Βόρεια και Νότια Αμερική. Τουλάχιστον 349 είδη έχουν παρατηρηθεί στο νησί, αλλά μόνο 120 είναι γνωστά να αναπαραγάγονται εκεί. Δεκαέξι είδη είναι θηλυκά στο αρχιπέλαγος του Puerto Rico, και 42 είδη έχουν εισαχθεί από ανθρώπους. Τα νοτιοαμερικανικά πουλιά περιλαμβάνουν Κολομπριτές, Tyrant Flycatchers, Bananaquit (το πιο αφθόνο πουλί στο Puerto Rico) και Tangara. Το Stripe-headed Tanager είναι το εθνικό πουλί.
Τα θηλυκά πουλιά του Puerto Rico περιλαμβάνουν το Tody, το οποίο είναι συχνό σε όλο το Caraïβια, και το κίτρινο-ωμωτό μαύρο πουλί. Διάφορα είδη είναι απειλούμενα. Το Παπαγάλο Puerto Rican σχεδόν εξαφανίστηκε το 1975 και παραμένει στη λίστα απειλούμενων ειδών. Το Amazon παπαγάλο Puerto Rican είναι μεταξύ των top 10 απειλούμενων ειδών στον κόσμο. Το Hispaniolan Parakeet, το White-Necked Crow, το Cuban Crow, και το Limpkin πλησιάζουν στο να είναι απειλούμενα, και το Black-bellied Whistling Duck, το Black Rail και το Greater Flamingo δεν έχουν πλέον τόπους αναπαραγωγής στο αρχιπέλαγος του Puerto Rico.
Αρχικά, το νησί του Puerto Rico καλύφθηκε από δάσος, αλλά η εκκένωση για γεωργία και ξύλο άλλαξε το habitat, και διάφορα εισαγόμενα είδη είναι παρόντα στο νησί, συμπεριλαμβανομένων λουλουδιών. Οι Bougainvilleas βρίσκονται στους περισσότερους κήπους, και έχουν διαδοθεί επίσης στο άγριο. Το κράτος λουλούδι είναι το Puerto Rican hibiscus.
Τα θηλυκά λουλούδια βρίσκονται κυρίως στα βουνά. Αυτά περιλαμβάνουν τα impatiens, το οποίο είναι συχνό στους κήπους στην ηπειρωτική ΗΠΑ. Περισσότερα από 50 ποικιλίες ορχιδέας μπορούν επίσης να βρεθούν στα βουνά. Τείνουν να είναι μικρότερες από τις ποικιλίες ορχιδέας σε άλλες τοποθεσίες, η μικρότερη το μέγεθος ενός δακτυλίου. Οι ορχιδέες μεγαλώνουν μαζί με τα bromeliads, τα οποία μοιάζουν με ανανάδες με φύλλα αντί για καρπό, και ένα χρωματιστό σωλήνα στο κέντρο.
Υπάρχουν τέσσερεις τύποι δασών στο Puerto Rico, κυριαρχούμενα από διαφορετικά δέντρα. Στην βόρεια πλευρά του νησιού, κυριαρχούν τα τροπικά δάση βροχής. Η ταξινόμηση εξαρτάται από την υψόμετρο πάνω από την επιφάνεια της θάλασσας. Κοντά στην επιφάνεια της θάλασσας είναι το υποτρόπικο υγρό δάσος, το "Tabonuco forest," το οποίο ονομάζεται από το δέντρο Tabonuco που κυριαρχεί σε αυτό.
Πάνω από αυτό έρχεται μια περιοχή υποτρопиκού δάσους, το Colorado forest (ονομασμένο από το δέντρο Colorado), και το δάσος φοινίκων. Κοντά στην κορυφή είναι το νάνο δάσος, όπου τα δέντρα δεν φτάνουν πάνω από τρία μέτρα ύψος, και υπάρχουν ανοιχτά κομμάτια και βότανα φυτά.
Πολλά από αυτά τα δέντρα έχουν χρωματιστά λουλούδια, συμπεριλαμβανομένων των epiphytes (φυτά που μεγαλώνουν στα δέντρα) και, στη ψηλότερη υψόμετρο, τα βότανα φυτά.
Ακόμα και αν το νησί είναι τροπικό, η νοτιοδυτική ακτή είναι ξηρή, και υπάρχουν διάφορες ποικιλίες κάκτους που μεγαλώνουν εκεί.
Το Puerto Rico έχει δύο μεγάλα φύσεις αποθήκες, κατασταθείσες για τη διατήρηση των θηλυκών ειδών φυτών και ζώων. Στη νοτιοδυτική πλευρά, η Commonwealth Forest Reserve Guánica περιλαμβάνει 15 τετραγωνικά μίλια ξηράς γης, με περισσότερους από 600 είδη φυτών και ζωικής ζωής που σπάνια βρίσκονται αλλού. Σαράντα οκτώ από αυτά είναι απειλούμενα.
Στην άλλη πλευρά του νησιού, η αποθήκη βροχοδάσους El Yunque έχει περισσότερους από 240 διαφορετικά είδη φυτών, από τα οποία 26 είναι θηλυκά στο Puerto Rico. Εδώ, 50 είδη πουλιών βρίσκονται επίσης, συμπεριλαμβανομένου του κριτικά απειλούμενου Amazon παπαγάλου Puerto Rican.
