Παρόλο το μικρό μέγεθος (~3 φορές το Rhode Island), το Πουέρτο Ρίκο έχει ποικιλόμορφο τοπίο. Από ορεινές περιοχές σε παραλιακές πεδιάδες, έρημα σε δάση υγρής – αποτέλεσμα βουλκανικής δραστηριότητας από τώρα νεκρό βουλκάνο. Η ποικίλη τοπογραφία δημιούργησε μοναδική καρστική περιοχή γεμάτη σπηλαίες και καταβόθρες.
Μικρότερο και ανατολικότερο νησί της αλυσίδας Greater Antilles. Πλειοψηφία βουνό/στριμμένα λόφοι. Η ριπα τη γεωγραφία οδήγησε σε βιομηχανικές δραστηριότητες (γεωργία δύσκολη). Λιγότερο από 10% γης για γεωργία (CIA World Factbook).
Το εσωτερικό κυριαρχείται από το βουνό, τοπικά Cordillera Central. Αλυσίδα βουνών ανατολικά-δυτικά όλο το νησί. Κλάδοι: La Cordillera Central, La Sierra de Cayey, La Sierra de Luquillo, La Sierra Bermeja. Πολλές κορυφές >1.219μ (4.000 πόδια). Υψηλότερο: Cerro La Punta 1.338μ (4.390 πόδια) (City-Data.com).
Δημιουργήθηκαν από διάβρωση εσωτερικών βουνών. Παραλιακές πεδιάδες: ~16 χλμ (10 μίλια) βόρεια, ~3-13 χλμ (2-8 μίλια) νότια (Puerto Rico Encyclopedia). Προominant άμμουδες παράκτιες. Κοντά: Mona Passage (μεγάλο ναυσιπλοϊκό κανάλι για Παναμαϊκό Κανάλι). San Juan: ένα από τα μεγαλύτερα/καλύτερα φυσικά λιμάνια Καραϊβικών (CIA World Factbook).
Βορειοδυτική ακτή: Aguada-Loíza karst region. Σύμφωνα με Watersheds.org, καρστικό πεδίο δημιουργείται όταν η ψαμμώδης πέτρα φθείρεται από υπόγεια νερά. Σπηλαίες, σωλήνες, καταβόθρες μένουν. Η περιοχή σχηματιστike αιώνες από τον Río Camuy, 3ο μεγαλύτερο υπόγειο ποτάμι κόσμου. Δημιουργήसे εκτεταμένο σπηλαιώδες σύστημα (ένα από τα μεγαλύτερα Δυτικής ημισφαιρίας). Γραμμή χαρακτηριστικών από Aguadilla (δυτικά) έως minor haystack hills στην Loíza (ανατολικά San Juan).
Πέρα από Río Camuy, >50 υδροδρομίες διέρχονται, καμία αρκετά μεγάλη για μεγάλο πλοίο (City-Data.com). Πλειοψηφία ρέει βορειά, εκκενώνουν στον Ατλαντικό. Λίμνες: κυρίως τεχνητά αποθεματικά από φράγματα, παράγουν υδροηλεκτρική ενέργεια.
