Το Mission San Jose (στην παρούσα Φρεμόντο, Καλιφόρνια) βρίσκεται σε γεωλογικά ενεργή περιοχή με πολλαπλούς φυσικούς κινδύνους. Το ιστορικό συγκρότημα μισσίων, ιδρυμένο 1797, έχει αντέξει σεισμούς, πλημμύρες, και απειλές πυρκαγιάς για πάνω από δύο αιώνα.
Το μισσίο βρίσκεται <1 χλμ από τη Διάρρηξη Χέιγουορντ, ένα σημαντικό κλαδί του συστήματος Σαν Ανδρέας ικανή για M7+ σεισμούς. Ο σεισμός Χέιγουορντ 1868 (M6,8) κατέστρεψε την αρχική πηλοδομική εκκλησία. Ο σεισμός Λομά Πριέτα 1989 (M6,9, 50 χλμ μακριά) κατακλύζει τον ανακατασκευασμένο καμπανιά της εκκλησίας. Τα τρέχοντα κτίρια ενσωματώνουν σεισμική ενίσχυση, αλλά η αναδρομή 140 ετών της διάρρηξης κάνει πιθανό μεγάλο γεγονός αυτόν τον αιώνα.
Το Ρεύμα Αλαμέδα τρέχει παράλληλα με τη δυτική ακμή του μισσίου. Η λεκάνη απορροής του παράγει φλιστακές πλημμύρες κατά έντονες χειμερινές καταιγίδες. Μεγάλες πλημμύρες το 1982 και 1998 πλημμύρισαν το έδαφος του μισσίου και τις γύρω γειτονιές. Η αστικοποίηση ψηλότερα έχει αυξήσει τις κορυφαίες ροές. Καταστρέψεις ελέγχου πλημμύρας και λεκάνες κατštěσεως πλέον μετριάζουν αλλά δεν εξαλείφουν τον κίνδυνο.
Το μισσίο καθίζει στο περίγραμμα του Διαβόλου Range, όπου ξερές καλοκαίρια, άνεμοι Διαβόλου, και φλογερή θυμιαμάτι δημιουργούν υψηλό κίνδυνο πυρκαγιάς. Η πυρκαγιά Οακλαντ Χίλς 1991 (3.000+ δομές χαμένες) συνέβη μόλις χιλιόμετρα μακριά. Οι καταιγίδες σπινθήρων μπορούν να ανάψουν δομές μίλια μακριά από το μέτωπο της φλόγας. Άμυνα χώρος και πυρίδια στέγης είναι κρίσιμα.
Το μισσίο (τώρα εκκλησία παρεγγυήσεων και μουσείο) συμμετέχει σε ασκήσεις ShakeOut, διατηρεί επείγουσες αποθέσεις, και συντονίζεται με Alameda County OES. Τα μη-ενισχυμένα μονόλιθα στοιχεία παραμένουν σεισμικό ανησυχία παρά τις ανακατασκευές.
Η ιστορία του Mission San Jose είναι γραμμένη σε γεωλογικά γεγονότα—κάθε καταστροφή ένα κεφάλαιο στην ιστορία μιας κοινότητας που επιμένει σε ενεργή λιθική πλακίδα.