Μετά την ήττα τους από βιετναμικές δυνάμεις τον Ιανουάριο 1979 (όχι 1978 — η Βιετνάμ ξεκίνησε την πλήρη εισβολή τέλη Δεκεμβρίου 1978, κατακτώντας τη Φνομ Πενχ την 7 Ιανουαρίου 1979), η ηγεσία των Κμερ Ρουζ και τα υπόλοιπα του στρατού τους φύγατε δυτικά στην Ταϊλάνδη.
Ειδρύσαν καταφύγια παρενέργειες μακριά του συνόρου Θαϊ-Καμποδίας, από όπου διενήργησαν γκουερίλλα αντεπίθεση εναντίον της νέας βιετναμικής υποστηριζόμενης Λαϊκής Δημοκρατίας της Καμποδίας για περισσότερο από μια δεκαετία, με κρυφή υποστήριξη από Κίνα, ΗΠΑ, και ΑΣΕΑΝ χώρες που αντέθηκαν στην βιετναμική επέκταση.
Οι Κμερ Ρουζ κράτησαν την καρέδρα της Καμποδίας στην ΟΗΕ μέχρι το 1991, παρά την απόθεσή τους.
