Η Βοσνία και Ερζεγοβίνα ποτέ δεν ιδρύθηκε επίσημα ως μουσουλμάνος κράτος στον σύγχρονο νόημα θεοκρατικού ή συνταγματικά ισλαμικού έθνους. Ωστόσο, κατά την Οθωμανική περίοδο (1463–1878), ο Ισλαμισμός γίναμε η κυρίαρχη θρησκεία στην περιοχή, διαμορφώνοντας βαθιά τη δημογραφία, τον πολιτισμό, την αρχιτεκτονική και τις κοινωνικές δομές.
Η οθωμανική κατάκτηση έφερε αιώνες ισλαμικής διακυβέρνησης, κατά τη οποία πολλοί Βοσνιάκοι μετέτρεψαν στον Ισλαμισμό — συχνά σταδιακά, επηρεασμένοι από κοινωνική κίνηση, φορολογικές πολιτικές και την ενσωμάτωση των τοπικών ελίτ στο αυτοκρατορικό σύστημα. Μέχρι τον 17ο αιώνα, οι μουσουλμάνοι αποτελούσαν πλειοψηφία ή πλειοψηφία σε πολλά αστικά κέντρα, συμπεριλαμβανομένων της Σαράγεβο, Μόσταρ και Τραβνίκ.
Τζαμίδες, μερασεσ, τεκκές (σουφι λότζια) και μπαζάρια ανθοφορούσαν, δημιουργώντας έναν ξεχωριστό βосνιακό ισλαμικό πολιτισμό που συνθύμιζε οθωμανικές παραδόσεις με τοπικά σλαβικά έθιμα. Αυτή η κληρονομιά διαμένει στην αρχιτεκτονική, την κουζίνα, τη μουσική και το γεγονός ότι περίπου το 50% του πληθυσμού αυτονομεῖ ως μουσουλμάνος σήμερα (κυρίως Σούννι, Χανεφίτικο μαζαμπ).
Μετά το 1878, η αστρο-ουγγρική διοίκηση και αργότερα η γιουγκοσλαβική αρχή εισήγαγαν laikά πλαίσια, αλλά η οθωμανική ισλαμική κληρονομιά παραμένει θεμελιώδες στρώμα της βοσνιακής ταυτότητας — ούτε «μουσουλμάνος κράτος» νόμιμα, όμως χώρα όπου ο Ισλαμισμός ήταν πλειοψηφία θρησκεία για αιώνες.
