1. Καταρράκτες και ορμητικά νερά :Πολλοί αφρικανικοί ποταμοί έχουν καταρράκτες και ορμητικά νερά, που καθιστούν την πλοήγηση δύσκολη ή αδύνατη. Για παράδειγμα, οι καταρράκτες Victoria στον ποταμό Zambezi είναι ένας από τους μεγαλύτερους καταρράκτες στον κόσμο και δημιουργεί ένα σημαντικό εμπόδιο στη ναυσιπλοΐα.
2. Εποχιακές παραλλαγές :Η ροή πολλών αφρικανικών ποταμών ποικίλλει σημαντικά ανάλογα με την εποχή. Κατά τη διάρκεια της ξηρής περιόδου, ορισμένα ποτάμια μπορεί να γίνουν πολύ ρηχά για ναυσιπλοΐα, ενώ κατά τη διάρκεια της περιόδου των βροχών, μπορεί να γίνουν πολύ ρηχά.
3. Sandbars και ιζήματα :Πολλοί αφρικανικοί ποταμοί μεταφέρουν πολλά ιζήματα, τα οποία μπορούν να δημιουργήσουν αμμώδεις ράβδους και λάσπες που δυσκολεύουν την πλοήγηση.
4. Πολιτική αστάθεια :Ορισμένες αφρικανικές χώρες έχουν βιώσει πολιτική αστάθεια και συγκρούσεις, γεγονός που μπορεί να δυσχεράνει τη συντήρηση και την ανάπτυξη υποδομών μεταφορών στα ποτάμια.
5. Έλλειψη υποδομής :Πολλές αφρικανικές χώρες δεν διαθέτουν την απαραίτητη υποδομή για την υποστήριξη των ποτάμιων μεταφορών, όπως λιμάνια, αποβάθρες και αποθήκες.
6. Οικονομικοί παράγοντες :Το κόστος μεταφοράς εμπορευμάτων μέσω του ποταμού μπορεί να είναι υψηλότερο από άλλους τρόπους μεταφοράς, όπως οι οδικές ή οι σιδηροδρομικές μεταφορές, καθιστώντας τις ποτάμιες μεταφορές λιγότερο οικονομικές.
7. Ασθένεια :Ορισμένα αφρικανικά ποτάμια φιλοξενούν ασθένειες όπως η ελονοσία και ο κίτρινος πυρετός, που μπορεί να θέτουν σε κίνδυνο την υγεία όσων χρησιμοποιούν τα ποτάμια για μεταφορές.