* Θάλασσα της Ιάβας: Ανάμεσα στα νησιά Ιάβα, Σουμάτρα, Βόρνεο και Σουλαουέζι, η Θάλασσα της Ιάβας είναι μια ημι-κλειστή θάλασσα που συνδέει τον Ινδικό Ωκεανό με τον Ειρηνικό Ωκεανό. Είναι ένας από τους πιο πολυσύχναστους ναυτιλιακούς δρόμους στον κόσμο και φιλοξενεί πολλά μεγάλα λιμάνια, συμπεριλαμβανομένης της Τζακάρτα, της πρωτεύουσας της Ινδονησίας.
* Θάλασσα Celebes: Ανάμεσα στα νησιά Σουλαουέζι, Βόρνεο και Φιλιππίνες, η θάλασσα Celebes είναι μια βαθιά θάλασσα που φτάνει σε βάθη πάνω από 6.000 μέτρα. Είναι το σπίτι πολλών κοραλλιογενών υφάλων και είναι ένα δημοφιλές σημείο καταδύσεων.
* Banda Sea: Ανάμεσα στα νησιά Sulawesi, Maluku και Timor, η θάλασσα Banda είναι μια βαθιά θάλασσα που φτάνει σε βάθη πάνω από 7.000 μέτρα. Είναι το σπίτι σε πολλά ενεργά ηφαίστεια και είναι γνωστό για την πλούσια θαλάσσια ζωή του.
* Θάλασσα Αραφούρα: Βρίσκεται ανάμεσα στα νησιά της Νέας Γουινέας και της Αυστραλίας, η Θάλασσα Arafura είναι μια ρηχή θάλασσα που φτάνει σε βάθη λιγότερο από 200 μέτρα. Είναι το σπίτι σε αρκετούς κοραλλιογενείς υφάλους και είναι ένας δημοφιλής ψαρότοπος.
* Θάλασσα του Τιμόρ: Βρίσκεται ανάμεσα στα νησιά Τιμόρ, Αυστραλία και Νέα Γουινέα, η Θάλασσα του Τιμόρ είναι μια βαθιά θάλασσα που φτάνει σε βάθη πάνω από 3.000 μέτρα. Είναι το σπίτι σε πολλά κοιτάσματα πετρελαίου και φυσικού αερίου και είναι μια σημαντική ναυτιλιακή διαδρομή.
* Ινδικός Ωκεανός: Ο Ινδικός Ωκεανός είναι ένας μεγάλος ωκεανός που συνορεύει με την Ινδονησία στα νότια. Είναι ο τρίτος μεγαλύτερος ωκεανός στον κόσμο και φιλοξενεί πολλές μεγάλες ναυτιλιακές λωρίδες.