Το δάσος της Αμαζονίας αποστραγγίζεται από ένα τεράστιο δίκτυο ποταμών, το μεγαλύτερο από τα οποία είναι ο ίδιος ο Αμαζόνιος. Αυτό το περίπλοκο σύστημα περιλαμβάνει αριστούς σημαντικές εισροές που μαζί δημιουργούν μια από τις υδροπλουσιότερες περιοχές του πλανήτη.
Ο δεύτερος μακρύτερος ποταμός του κόσμου και ο μεγαλύτερος κατά όγκο εκροής, ο Αμαζόνιος ρέει μέσω Βραζιλίας, Περού, Κολομβίας, Βενεζουέλας, Βολιβίας, Ισημερινούς και Γουιάνας, αποστραγγίζοντας περιοχή περίπου 7 εκατομμύρια τετραγωνικών χιλιομέτρων.
Στη Βραζιλία, ο ανώτερος Αμαζόνιος ονομάζεται Σολιμόες. Ρέει δυτικά από τα Άνδη στη Μανάους, όπου συγχωνεύεται με το Rio Negro για να σχηματίσει τον κύριο τράχηλο του Αμαζόνιου.
Μια από τις μεγαλύτερες εισροές του κόσμου, το Rio Negro ρέει βορειά από τα Υψηλά Γουιάνας μέσω Βενεζουέλας και Βραζιλίας. Τα σκοτεινά, χαιμοειδή νερά του συναντούν τα αμμώδη νερά του Σολιμόες στη Μανάους σε μια εκπληκτική «σύνανση των νερών» που τρέχουν παράλληλα για χιλιόμετρα.
Μια σημαντική εισροή που προκύπτει στην βραζιλιανή πολιτεία Ροντονία, ο Πούρους ρέει δυτικά για να ενώσει τον Αμαζόνιο κοντά στη Μανάους, ελικοειδώς μέσω τεράστιων δασών πλημμυρίδας.
Το Μαντερά είναι η μεγαλύτερη εισροή του Αμαζόνιου κατά εκροή. Ρέει από τα Βολιβιανά Άνδη στη Πόρτο Βέλο, Βραζιλία, όπου συναντά τον Αμαζόνιο, συνεισφέροντας τεράστια φορτία ιλίου από τα Άνδη.
Αυτή η καθαρή-νερού εισροή ρέει νότια από το Ματό Γκρόσο στη Σανταρέν, όπου ενώνεται με τον Αμαζόνιο. Τα διαφανή νερά της αντικρίζουν με τη φοινικοειδή ροή του κύριου ποταμιού.
Ένα άλλο καθαρό-νερού ποτάμι από το Ματό Γκρόσο, το Σινγκού ρέει νότια στην Αλταμίρα πριν συναντήσει τον Αμαζόνιο. Είναι γνωστό για την μοναδική βιοποικιλότητα και τις ενδημικές πολιτιστικές του ομάδες.
Ρέει βορειά από τα Υψηλά Γουιάνας στη Βραζιλία στην Οριξιμινά, το Τρομπετάς ενώνεται με τον Αμαζόνιο στην κάτω λεκάνη, αποστραγγίζοντας αρχαία σκυτάλια πετρώματα.
Πέρα από αυτές τις κύριες αρτηρίες, αμέτρητα μικρότερα ρυάκια και ρυάκια διείβουν τη λεκάνη, υποστηρίζοντας την ανυπέρβλη βιοποικιλότητα του δάσους και ρυθμίζοντας τον παγκόσμιο κλίμα.
