Η αλατότητα του Ευφράτη διακυμάνεται με την εποχή και την απόσταση από την εκβολή. Είναι γενικά πιο αλμυρός από τον Τίγρη ή τον Νεῖλο.
Ενώ δεν είναι τόσο αλμυρός όσο η θάλασσα (~35.000 mg/L), θεωρείται αλμυρός σε πολλά τμήματα, ειδικά κατευθυνόμενα ροής.