1. Η ίδρυση:Το 1791, ο Ισπανός Φραγκισκανός εξερευνητής και ιεραπόστολος, πατέρας Fermín Lasuén, ίδρυσε την αποστολή Santa Cruz. Ήταν η δωδέκατη από τις 21 ισπανικές αποστολές που ιδρύθηκαν στη σημερινή Καλιφόρνια. Η αρχική αποστολή βρισκόταν κοντά στις εκβολές του ποταμού San Lorenzo, αλλά αργότερα μετακόμισε στη σημερινή της τοποθεσία το 1797.
2. Αντίσταση των ιθαγενών της Αμερικής:Τα πρώτα χρόνια της αποστολής σημαδεύτηκαν από εντάσεις και συγκρούσεις με τους ιθαγενείς Ohlone. Το Ohlone αντιστάθηκε στο ιεραποστολικό σύστημα και στις προσπάθειές του να τους προσηλυτίσει στον καθολικισμό και να τους αφομοιώσει στην ισπανική κουλτούρα. Υπήρξαν αρκετές περιπτώσεις αντίστασης και εξεγέρσεων, συμπεριλαμβανομένης μιας σημαντικής εξέγερσης το 1824.
3. Εκκοσμίκευση:Στη δεκαετία του 1830, η μεξικανική κυβέρνηση άρχισε να εκκοσμικεύει τις αποστολές στην Καλιφόρνια, με αποτέλεσμα να χαθούν τα εδάφη και οι περιουσίες τους. Η αποστολή Santa Cruz επηρεάστηκε από αυτή τη διαδικασία και τελικά εγκαταλείφθηκε από τους Φραγκισκανούς μοναχούς το 1841.
4. Επιστροφή ιθαγενών Αμερικανών:Μετά την εκκοσμίκευση, οι χώροι της ιεραποστολής χρησιμοποιήθηκαν για διάφορους σκοπούς, συμπεριλαμβανομένου ενός σχολείου και μιας στρατιωτικής θέσης. Στις αρχές του 20ου αιώνα, οι υπόλοιπες δομές αποκαταστάθηκαν και η αποστολή επέστρεψε στην Καθολική Εκκλησία το 1931. Το κρατικό ιστορικό πάρκο Santa Cruz Mission ιδρύθηκε το 1934 και επί του παρόντος διαχειρίζεται το Τμήμα Πάρκων και Αναψυχής της Καλιφόρνια.
5. Σεισμός του 1989:Η αποστολή υπέστη σημαντικές ζημιές κατά τον σεισμό της Loma Prieta το 1989. Ο σεισμός προκάλεσε την κατάρρευση του ιστορικού καμπαναριού της αποστολής και κατέστρεψε άλλες κατασκευές. Τα επόμενα χρόνια πραγματοποιήθηκαν εκτεταμένες εργασίες αποκατάστασης για την επισκευή και τη σταθεροποίηση του συγκροτήματος της αποστολής.
Σήμερα, η Mission Santa Cruz συνεχίζει να λειτουργεί ως ενορία και δημοφιλές ιστορικό αξιοθέατο. Προσφέρει στους επισκέπτες την ευκαιρία να μάθουν για την ιστορία της αποστολής, να εξερευνήσουν την όμορφη αρχιτεκτονική της και να εκτιμήσουν τον διαρκή ρόλο της ως κέντρο πίστης και κοινότητας στην περιοχή Santa Cruz.
