Μια συχνή παρεξήγηση είναι ότι η Πουέρτο Ρίκο έχει πρόεδρο. Δεν έχει. Ως εδαφικό τμήμα των ΗΠΑ, ο πρόεδρος της εκτελεστικής της Πουέρτο Ρίκο είναι ο Κυβερνήτης, εκλεγμένος από τον λαό της Πουέρτο Ρίκο κάθε τέσσερα χρόνια.
Από τις 2 Ιανουαρίου 2021, ο Πέδρο Πιερλούισι υπηρετεί ως Κυβερνήτης, διαδεχόμενος τον Ρικάρδο Росσελλό (που παραιτήθηκε το 2019) και τη Βάντα Βαζκέζ Γκαρσέδ. Ο Κυβερνήτης ηγείται του εκτελεστικού κλάδου, αναθέτει γραμματείς υπουργείων (με επιβεβαίωση Γερουσίας), και εκπροσωπά το νησί σε ομοσπονδιακά και διεθνή θέματα μέσα στα όρια της εδαφικής κατάστασης.
Η σύγχυση μπορεί να προκύψει από τον τίτλο της Πουέρτο Ρίκο—«Κοινωνία» (Estado Libre Asociado)—ή από το υψηλό βαθμό εσωτερικής αυτονομίας. Ωστόσο, η τελική κυριαρχική εξουσία ανήκει στο Κογκρέσο των ΗΠΑ υπό την Εδαφική Κλάδωση του Συντάγματος των ΗΠΑ. Ο Πρόεδρος των ΗΠΑ είναι ο Αρχή του Κράτους για την Πουέρτο Ρίκο, ακριβώς όπως για τις 50 πολιτείες.
