Η Μεσόγειος θάλασσα έχει μέσο βάθος περίπου 1.500 μέτρων (4.900 πόδια). Το βαθύτερο σημείο της είναι η Βάθυ του Καλυψώ στο Ιόνιο Πέλαγος, που βυθίζει στα 5.267 μέτρα (17.280 πόδια). Η πολύπλοκη βαθυμετρία της θάλασσας περιλαμβάνει數多 υπολεκάνες, φάραγγες και υφαλοκρημνούς, διαμορφωμένους από τη συνεχούμενη σύγκρουση των αφρικανικών και ευρασιατικών τεκτονικών πλάκων.
