Το κοράλλι εγκεφάλου ευδοκιμεί σε ζεστά, ρηχά νερά, συνήθως σε βάθη μικρότερα από 18 μέτρα (60 πόδια). Αυτό το είδος ευνοεί τροπικά περιβάλλοντα που χαρακτηρίζονται από καθαρά, ηλιόλουστα συνθήκες που προωθούν τη βέλτιστη φωτοσύνθεση για τις συμβιωτικές του φύκες. Απαιτεί φώτο φως για παραγωγή θρεπτικών και ανθίζει σε καλά οξυγονωμένα habitats με μέτριες έως ισχυρές ρεύματα ή κύμα.
Το κοράλλι εγκεφάλου μπορεί να βρεθεί σε ευρεία γκάμα τροπικών περιοχών, συμπεριλαμβανομένων:
Η προτίμησή του για συγκεκριμένες συνθήκες φωτός, θερμοκρασίας και ροής νερού το περιορίζει σε αυτές τις τροπικές και υποτροπικές ζώνες.
