Το Ίδρυμα Great Barrier Reef είναι ένας μη κερδοσκοπικός οργανισμός που συγκεντρώνει κεφάλαια για έρευνα, εκπαίδευση και προσπάθειες διατήρησης για την προστασία του Great Barrier Reef. Το ίδρυμα συνεργάζεται με κυβερνήσεις, πανεπιστήμια, ερευνητικά ιδρύματα και άλλους οργανισμούς για να υποστηρίξει έργα που αντιμετωπίζουν τις απειλές που αντιμετωπίζει ο ύφαλος, όπως η κλιματική αλλαγή, η ρύπανση, η υπεραλίευση και ο τουρισμός.
Αυστραλιανό Ινστιτούτο Θαλάσσιας Επιστήμης
Το Αυστραλιανό Ινστιτούτο Θαλάσσιας Επιστήμης (AIMS) είναι ένας ερευνητικός οργανισμός που χρηματοδοτείται από την κυβέρνηση που διεξάγει επιστημονική έρευνα στον Μεγάλο Κοραλλιογενή Ύφαλο. Οι επιστήμονες της AIMS εργάζονται για να κατανοήσουν την οικολογία, τη βιοποικιλότητα και την ανθεκτικότητα του υφάλου και να αναπτύξουν στρατηγικές διαχείρισης για την προστασία του υφάλου.
Τμήμα Περιβάλλοντος και Επιστήμης του Κουίνσλαντ
Το Τμήμα Περιβάλλοντος και Επιστήμης του Κουίνσλαντ (DES) είναι η κρατική κυβερνητική υπηρεσία που είναι υπεύθυνη για τη διαχείριση και την προστασία του Μεγάλου Κοραλλιογενούς Ύφαλου. Το DES συνεργάζεται με άλλες κυβερνητικές υπηρεσίες, ερευνητικά ιδρύματα και ενδιαφερόμενους φορείς για την ανάπτυξη και εφαρμογή πολιτικών και κανονισμών για την προστασία του υφάλου.
World Wildlife Fund
Το Παγκόσμιο Ταμείο Άγριας Ζωής (WWF) είναι ένας διεθνής οργανισμός διατήρησης που εργάζεται για την προστασία των απειλούμενων ειδών και των οικοτόπων τους σε όλο τον κόσμο. Το WWF εργάζεται στον Μεγάλο Κοραλλιογενή Ύφαλο από τη δεκαετία του 1970 και υποστηρίζει τις προσπάθειες έρευνας, εκπαίδευσης και διατήρησης για την προστασία του υφάλου.
Greenpeace
Η Greenpeace είναι ένας διεθνής περιβαλλοντικός οργανισμός που εργάζεται για την προστασία του περιβάλλοντος και την προώθηση της ειρήνης. Η Greenpeace διεξάγει εκστρατεία για την προστασία του Μεγάλου Κοραλλιογενούς Υφάλου από τη δεκαετία του 1980 και έχει ζητήσει την απαγόρευση της εξόρυξης άνθρακα και της ναυτιλίας στην περιοχή.