Ο Ποταμός Madeira, μεγάλος υπολειτουργός του Αμαζονίου στη Βολιβία και τη Βραζιλία, είναι σχετικά ρηχός για τον όγκο του. Τυπικά βάθη στο κύριο κανάλι κυμαίνονται από 17 έως 18 μέτρα (56–59 πόδια) στις περισσότερες ενότητες. Τα βάθη ποικίλλουν εποχιακά: κατά τη βροχερή περίοδο (Δεκ–Μάιος), η πλημμυρική εκτάση αυξάνει το διαγώνιο τομή αλλά το βάθος του κύριου καναλιού μπορεί να μην αυξάνεται αναλογικά. Στη ξηρή περίοδο, τα βάθη μπορούν να πέσουν κάτω από 10 μέτρα σε ορισμένες εκτάσεις. Ο ποταμός μεταφέρει τεράστια φορτία ιλύος (Ανδεϊκή προέλευση), διαμορφώνοντας μεταβαλλόμενες αμμωδείς τόξα και πολυκαμπύλους κανάλια που δυσχεραίνουν την πλοήγηση. Μεγάλα πλοία (φορτηγά έως 2.000 τόνους) λειτουργούν με προσεκτικό πλοηγισμό· πυκνές bathymετρικές ανασκοπήσεις.
