Η Ιλλinois μπορεί να λείπουν βουνά (το υψηλότερο σημείο, Charles Mound, είναι ένα μετριόταπο 1.235 πόδια), αλλά είναι πλούσια σε υδατικά δίκτυα που ορίζουν τη γεωγραφία, την οικονομία, και την αναψυχή της.
Το Μισισιπί σχηματίζει ολόκληρο το δυτικό όριο της Ιλλinois (580 μίλια). Είναι το μεγαλύτερο ποταμικό σύστημα της ηπείρου, μεταφέρον 60% των εξαγωγών σιταριού ΗΠΑ. Το Great River Road scenic byway ακολουθεί τη πορεία του. Φράγματα και κλειστρά (19 στο Upper Mississippi) διατηρούν 9-πόδι κανάλι πλοήγησης για βάρκες.
Ρέοντας 273 μίλια διαγώνια στο πολιτεία από βορειοανατολικά προς νοτιοδυτικά, ο Ποτάμιος Illinois συνδέει τη Λίμνη Μιχιγάν (μέσω του Chicago Sanitary and Ship Canal) με το Μισισιπί. Είναι σημαντικό εμπορικό υδατικό δρόμο και αναψυχιακό δρόμο, με εκτεταμένα backwater λίμνες και υγρότοπα (Chautauqua, Emiquon) αποκατεστημένα για habitat.
Η Ιλλinois διεκδικεί 63 μίλια ακτής Λίμνης Μιχιγάν — η μπροστινή αυλή του Σικάγο. Η λίμνη παρέχει πότιμο νερό για 7 εκατ., υποστηρίζει $3δισ+ αναψυχιακή οικονομία, και μετριάζει το κλίμα του Σικάγο. Indiana Dunes και Illinois Beach State Park προστατεύουν σπάνια habitats ακτοπλοϊκών.
Γλακιαρικές λίμνες στη βορειοανατολική (π.χ. Pistakee Lake, Chain O'Lakes στο Fox River) και oxbow λίμνες langs ποταμούς (Horseshoe Lake, κ.λπ.). Οι περισσότερες "λίμνες" στην Ιλλinois είναι ταμιευτήρια.
Τα υδατικά δίκτυα της Ιλλinois υποστηρίζουν εμπορική πλοήγηση ($30δισ+ ετήσιο φορτίο), αθλητική αλιεία ($1,5δισ+ οικονομική επίδραση), ναυτιλία, birding (μεγάλο Mississippi Flyway), και αυξανόμενο δίκτυο μονοπατιών kayak. Προβλήματα ποιότητας νερού — θρεπτικά runoff, φθορά, εισβάλλοντα είδη (ασιατικό καρφί, zebra mussels) — παραμένουν ενεργά προτεραιότητες διαχείρισης.
