Ο Ινδικός Ωκεανός φιλοξενεί εξαιρετική θαλάσσια ποικιλία, από πελαγικά γίγαντες έως κρυπτά ριφωδείς οικισμούς. Παρακάτω είναι μια επιλεγμένη στιγμιότυπο σημαντικών ομάδων ειδών.
Ξιφιδόντια & Τόνους: Μπλε μαρλίν, μαύρο μαρλίν, ξιφίας, ιστιοφόρος, γκου, μαχι-μαχι, κίτρινος, μπλεφιν, μακρόφθαλμος, αλακόρ, και σκαμπρί τόνους.
Καρχαρίες: Λευκή, τίγρης, ταύρος, σφυρίδες, μωκο, θρέσερ, νουρίδα, καρχαρίας φάλαινα.
Βάτοι: Μάντα, μωβούλα, αετόβατος, ρινόβατος, σοβελνοσ βάτοι.
Ροφάδες: Γολιάθ, μαύρη, κόκκινη, νασσάου, βραχυοδούς, κονεί.
Σνάππερ: Κόκκινος, μουττον, λεϊν, κίτρινη ουρά, μαγγροβί, σκύλος σνάππερ.
Άλλα ριφωδείς ψάρια: Μπαρρακούδα, κομπία, βασιλικός/ισπανικός κολοκύθι, μπλε ρομπέρ, ράινμπο ρομπέρ, τρικάρ, παπαγάλοψαρο, ξιφιά, λιονφις, σκορπιοφις, πετρόφις.
Χταπόδια, καλαμάρια, αστακοί, γαρίδες, καβούρια—κρίσιμα στοιχεία του τροφικού ιστού και εμπορικών αλιειών.
Αυτή η λίστα είναι μακριά από εξαντλητική· τα κοραλλιογενή ρίφ, τα υφαλοβουνά, και οι ζώνες ανόδου του Ινδικού Ωκεανού υποστηρίζουν χιλιάδες ακόμα είδη, πολλά ακόμα ακαταγράφητα.
