Τα μανατί βρίσκονται στα θερμά νερά της δυτικής πλευράς του Ατλαντικού Ωκεανού και της Καραϊβικής Θάλασσας. Συνήθως στις υδές της Φλόριντας συναντάται το Δυτικό Ινδικό Μανατί, ένα μεταναστευτικό θηλαστικό που ταξιδεύει σε διαφορετικές τοποθεσίες αναζητώντας θερμό βιότοπο και τροφιμές. Μια απογραφή τον Ιανουάριο του 2000 βρήκε λίγο περισσότερους από 2.000 μανατί να ζουν στα νερά που περιβάλλουν και βρίσκονται μέσα στην Πολιτεία της Φλόριντα.
Τα μανατί μπορούν να βρεθούν σε σχεδόν οποιοδήποτε υδάτινο σώμα που έχει βάθος μεγαλύτερο από 1 μέτρο (3,25 πόδια). Έχουν εντοπιστεί σε ποτάμια, κόλπους, κανάλια και εκβολές ποταμών που έχουν σύνδεση με τα ωκεάνια. Γενικά, το μανατί βρίσκεται σε παραλιακά νερά κοντά στη χερσαία, αλλά κάποια έχουν δει μέχρι 80 χιλιόμετρα (50 μίλια) μακριά από τη γη, κοντά στα Κλειδιά της Φλόριντας.
Τα μανατί μπορούν να ζήσουν σε οποιονδήποτε τύπο νερού που βρίσκεται στη Φλόριντα και γύρω από αυτή, συμπεριλαμβανομένων γλυκών, αλμυρών ή αλατιστών και βρακισμένων υδάτων. Μανατί μπορούν να βρεθούν στα βρακισμένα νερά της Λιμνοθάλασσας Ινديان Ρίβερ, όπου τα νερά από τα εσωτερικά ποτάμια συναντώνται με το αλάτι νερό του Ατλαντικού. Το μανατί προσαρμόζεται εύκολα και επιβιώνει σε κάθε τύπο νερού και μπορεί να μεταβαίνει ελεύθερα μεταξύ τους.
Τα μανατί προτιμούν να ζουν σε ζεστά νερά, γενικά με θερμοκρασία υψηλότερη από 21 βαθμούς Κελσίου (70 Φαρενάιτ). Χειμώνα, το μανατί πηγαίνει προς την εσωτερική αναζητώντας θερμότερα νερά και μπορεί να παρατηρηθεί κοντά σε θερμοηλεκτρικές μονάδες, που απελευθερώνουν θερμότητα στα κοντινά νερά. Πάνω από 200 μανατί μπορούν να συγκεντρωθούν κοντά σε θερμοηλεκτρικές μονάδες τον χειμώνα, όπως στη Βερο Μπιτς, Καπ Καναβεράλλ, Φορτ Λαουντερντέιλ, Πορτ Εβεργλέιδς και Τάμπα Μπιτς.
Τα μανατί είναι φυτófαγα και επιβιώνουν με θαλάσσιες και λιμναίες φυτικές μορφές, όπως υποβρύχιες, αναδυόμενες και επιπλεούμενες βλάστησης. Οι βιότοποι τους πρέπει να έχουν αφθονία βλάστησης, γιατί χρειάζεται να τρώει το 10-15% του βάρους του καθημερινά. Τύποι υδατικής βλάστησης που τρώνε τα μανατί περιλαμβάνουν χόρτο μανατί, χελώνης, αμμολίμνης, γατιδιάς, ύδριλλα, ταινία χόρτο, ζοστέρα, υάκινθος νερού και λάχανο νερού.
