Ένα οικοσύστημα είναι μια κοινότητα φυτών και ζώων που ζουν μαζί. Η Φλορίδα είναι σπίτι για διάφορους τύπους οικοσυστημάτων. Ο τύπος οικοσυστήματος που θα ευδοκιμήσει σε μια συγκεκριμένη περιοχή εξαρτάται από διάφορα πράγματα. Το επίπεδο υγρασίας, αλλαγές στην υψόμετρα (ακόμα και λίγα ίντσες), αλατότητα νερού και τύπος εδάφους είναι μόνο μερικοί από τους παράγοντες που καθορίζουν τα οικοσυστήματα μιας συγκεκριμένης περιοχής.
Το νότιο άκρο της Φλορίδας περιέχει διάφορα μικρά κοραλλιογενή φραγμά. Ατομικά κοράλλια συνδέονται για να σχηματίσουν colonies. Ως αυτές οι colonies ανταγωνίζονται για χώρο, σχηματίζονται κοραλλιογενή φραγμά. Τα νερά της Φλορίδας περιέχουν πάνω από τριάντα διαφορετικούς τύπους κοραλλιών. Τα κοραλλιογενή φραγμά όχι μόνο παρέχουν φαγητό και καταφύγιο για διάφορα είδη θαλάσσιων ζώων, αλλά σχηματίζουν επίσης ένα φράγμα κύματος για την παρακειμένη ακτή. Το φράγμα κύματος παρέχει φυσική προστασία από καταιγίδες για τις εκτεθειμένες ακτογραμμές. Διάφοροι τύπους καρχαριών είναι κάτοικοι των κοραλλιγενών φραγμών της Φλορίδας. Οι angel sharks και zebra sharks είναι bottom dwellers, ενώ οι tiger sharks και lemon sharks είναι οι κύριοι predators σε αυτόν τον τύπο οικοσυστήματος. Ένα από τα κύρια απειλή στο οικοσύστημα κοραλλιγενών φραγμών είναι η παγκόσμια μείωση θερμοκρασίας. Η αύξηση της θερμοκρασίας των ωκεανών λεύκαινε τα κοράλλια. Όταν τα κοράλλια λεύκαινουν, δεν είναι πλέον πηγή φαγητού ή καταφυγίου για τα θαλάσσια ζώα που ζουν εκεί. Επίσης, ανεπιμελείς ναυτιλίες τρέχουν aground στα κοράλλια και συχνά προσπαθούν να ριχτούν αγκύρα τα πλοία τους απευθείας πάνω στα φραγμά. Δεν υπάρχει τρόπος να αντιστραφεί η ζημιά που γίνεται στα κοράλλια από αγκύρες πλοίων.
Οι αμμουδιές είναι λόφοι άμμου που δημιουργούνται από τον αέρα, αλλά κρατιούνται στη θέση τους από ψηλά θαλάσσια χόρτα που παγιδεύουν τα σωματίδια άμμου καθώς φουσκώνουν στην περιοχή. Οι αμμουδιές προστατεύουν την ακτή από αέρα και κύματα. Οι αμμουδιές είναι σημαντικά σημεία φωλιάσης για παράκτια πουλιά και χελώνες θαλάσσιες.
Οι βάλτοι είναι υγρότοποι με μεγάλη περιοχή χόρτου ή χορτοειδών φυτών. Οι βάλτοι συνήθως δεν περιέχουν δέντρα ή θάμνους. Ψάρια, βάτραχοι, φίδι, αλιγάτορες, ελάφια και το απειλούμενο φλορίδικο πάνθηρ είναι οι φυσικοί κάτοικοι των περιοχών βάλτων. Τα νεροπούλια πουλιών μπορεί να φωλιάσουν και να ψάχνουν φαγητό στους βάλτους. Οι βάλτοι περιέχουν στάσιμο νερό το μεγαλύτερο μέρος του έτους και μπορούν να λειτουργήσουν ως φυσικά συστήματα φίλτρασης νερού. Καθώς το νερό περνάει πάνω από μια περιοχή βάλτους, η ροή του νερού επιβραδύνει σημαντικά. Αυτό το επιβράδυνση επιτρέπει στα ιζήματα και σωματίδια να καθίσουν στο κάτω μέρος του βάλτου, αφήνοντας το γλυκύ νερό πάνω.
Αντίθετα με τους βάλτους, οι βάλτοι δάσος είναι συνήθως كثيفة δασωδείς υγρότοποι. Οι βίδρες και τα μαύρα αρκούδα είναι μερικά από τα ζώα που φτιάχνουν το σπίτι τους και ψαχνούν φαγητό στους βάλτους δάσος της Φλορίδας. Τα ξύλινα πελαργά, χρικοκοράκες και άλλα πουλιά κατοικούν επίσης τα βάλτωματα. Οι πάνθηρες επίσης έρχονται σε αυτές τις περιοχές.
Οι πευκοδάσος είναι οι πιο κοινές φυτικές κοινότητες στη Φλορίδα. Τα φυτά που φύονται στους πευκοδάσους είναι ανθεκτικά στη φωτιά επειδή οι πευκοδάσους διατηρούνται από τη φωτιά. Τα νεοφυτά πεύκων χρειάζονται πολύ φως για να φυτρώσουν, και οι φωτιές καταστρέφουν τα σκληρά ξύλα που προσπαθούν να ανταγωνιστούν για τον ήλιο, ενώ η παχύ φλοιός της πεύκου την προστατεύει από τη φωτιά. Μερικά από τα ζώα που ζουν στους πευκοδάσους περιλαμβάνουν ελάφια, σκίουρα, ρυζούλες, αρακοὺς και χελώνες χερσαίες.
Τα scrubs είναι κυρίως πευκοδάσος με παχύ υποβρύχιο από δρυτές και saw palmetto. Τα scrubs βρίσκονται σε ξερά, αμμώδη εδάφη, και τα φυτά που φύονται εδώ έχουν προσαρμοστεί σε πολύ ξηρές συνθήκες. Τα ζώα που ζουν στο scrub έχουν προσαρμοστεί σε σχεδόν ερημικές συνθήκες. Μερικά από αυτά τα ζώα περιλαμβάνουν χελώνες gopher, σαύρα και αράχνες.
