Οι υδατικοί πόροι της Τσαντ κυριαρχούνται από τη Λεκάνη Λίμνης Τσαντ, ζωστήρα για εκατομμύρια στο Σαέλ. Η υδρολογία της χώρας εστιάζει σε λίγους κρίσιμους λίμνες και ποταμούς, εξαιρετικά ευαίσθητους στην κλιματική μεταβλητότητα.
Λίμνη Τσαντ—ποτε μια από τις μεγαλύτερες λίμνες της Αφρικής—έχει συρρικνωθεί δραματικά από τη δεκαετία του 1960 λόγω μειωμένης βροχόπτωσης και υδραυλικών αποστράγγισεων. Παραμένει ζωτικής σημασίας για αλιεία, γεωργία, και κτηνοτροφία, κοινή από Τσαντ, Νίγηρ, Νιγηρία, και Καμερούν.
Λίμνη Φίτρι (νοτιοκεντρική) είναι λίμνη κλειστής λεκάνης που διακύμανε εποχιακά με τις βροχές, υποστηρίζοντας άγρια ζωή και νομαδικές κοινότητες.
Λίμνη Ιρό (ανατολική) είναι εποχιακή, σχηματίζεται κατά τις βροχές και ξεραίνεται την ξηρή εποχή, κρίσιμη για νομάδες κτηνοτρόφους.
Ποταμός Σάρι—κύριος ποταμός της Τσαντ—ρέει από τη Κεντροαφρικανική Δημοκρατία μέσω Τσαντ στη Λίμνη Τσαντ. Ναυσιπλεύσιμος σε τμήματα, υποστηρίζει μεταφορά, αλιεία, και άρδευση.
Ποταμός Λογόνε, σημαντικό υπονομευτικό του Σάρι, σχηματίζει μέρος του συνόρου Τσαντ-Καμερούν και υποστηρίζει εκτεταμένους υγρότοπους.
Ποταμός Μπαρ ελ Γκζάλ ενώεται με τον Σάρι κοντά στο Ν'Τζαμέννα, τρέφοντας πλούσιους υγρότοπους.
Αυτά τα υδατικά σώματα αντιμετωπίζουν πιέσεις από κλιματική αλλαγή, ανωτερικά φράγματα, και αυξανόμενη ζήτηση. Βιώσιμη διαχείριση είναι ουσιώδης για την περιφερειακή σταθερότητα.