Τα συστήματα μετρό ήδη μειώνουν την περιβαλλοντική επίδραση των μεταφορών μεταφέροντας πολλούς ανθρώπους σε μεγάλα οχήματα που παράγουν πολύ λιγή άμεση ρύπανση και απαιτούν λιγότερα απορρίψιμα υλικά από αυτοκίνητα ή λεωφορεία. Λειτουργώντας υπόγειο, ελευθερώνουν επίσης γη, η οποία μπορεί να επιτρέψει περισσότερους «πράσινους χώρους» όπως πάρκα. Ωστόσο, οι πόλεις, οι χειριστές μετρό και οι κατασκευαστές τρένων μπορούν να υλοποιήσουν ακόμα ιδέες για να κάνουν τα συστήματα μετρό ακόμα πιο οικολογικά.
Τα βαγόνια και οι στάσεις μετρό μπορούν να παρέχουν δοχεία ανακύκλωσης δίπλα στα κάδους σκουπιδιών για να ενθαρρύνουν την ανακύκλωση. Οι χειριστές μετρό μπορούν να παρέχουν ένα ή δύο κάδους για ανακύκλωση αντικειμένων που χρησιμοποιούνται συχνά κατά τα ταξίδια, όπως δοχεία ποτών και εφημερίδες. Σε περιοχές με νόμους καταθέσεως μπουκαλιών, το σύστημα μετρό μπορεί να αποκτήσει επιπλέον κεφάλαια ανακυκλώνοντας κουτιά σόδας και χυμών. Μια εναλλακτική που χρησιμοποιούν οι περισσότερες στάσεις μετρό στη Νέα Υόρκη είναι να διαχωρίζουν τα ανακυκλώσιμα από τα γενικά σκουπίδια μετά τη συλλογή.
Λόγω της απουσίας φωτός ηλίου, τα υπόγεια τρένα και στάσεις πρέπει να παρέχουν επαρκή φωτισμό για εργαζόμενους και επιβάτες. Ωστόσο, είναι δυνατόν να γίνει ο φωτισμός του μετρό πιο οικολογικός χρησιμοποιώντας αποδοτικές λάμπες και σβήνοντας περιττούς φώτα. Το σύστημα μετρό στο Washington, D.C. άρχισε να χρησιμοποιεί λάμπες LED (light emitting diode) το 2007 για να φωτίσει τις στάσεις του. Τέτοια οικολογικά φώτα χρησιμοποιούν λιγότερο ρεύμα και δεν απαιτούν αντικατάσταση τόσο συχνά όσο οι λάμπες θωρακισμού ή φλορεσцент. Τα τρένα που ταξιδεύουν και επίγειος μπορούν να σβήσουν μερικούς εσωτερικούς φωτίστες τη μέρα.
Τα συστήματα μετρό συνήθως τρέχουν σε ηλεκτρισμό, δίνοντας στους χειριστές την δυνατότητα να τα τροφοδοτήσουν χρησιμοποιώντας ανανεώσιμη ενέργεια χωρίς τροποποίηση των βαγονιών. Ένα μετρό που τροφοδοτείται με ηλιακή, υδροηλεκτρική ή γεωθερμική ενέργεια δεν θα παράγει εκπομπές. Αν μια πόλη ή χώρα αφοσιώσει συγκεκριμένα ανανεώσιμη ενέργεια για τη λειτουργία ολόκληρου του συστήματος μετρό, μπορεί να προωθήσει τη χρήση του υπόγειου ως μέσο μεταφοράς «μηδενικών εκπομπών». Η πόλη του Bilbao, Ισπανία, για παράδειγμα, όργανωσε το σύστημα μετρό της να λειτουργεί εξ ολοκλήρου με καθαρή ενέργεια και ενέργεια ανακτημένη από τη χρήση φρένων τρένων.
Ως με κάθε όχημα, είναι σημαντικό να ληφθεί υπόψη όχι μόνο η περιβαλλοντική επίδραση της λειτουργίας ενός τρένου μετρό αλλά και οι επιπτώσεις της κατασκευής του από την αρχή. Οι κατασκευαστές μπορούν να παράγουν τέτοιο εξοπλισμό πιο οικολογικά χρησιμοποιώντας ανανεώσιμες πηγές ενέργειας και εργαζόμενα με ανακυκλωμένα υλικά όταν είναι δυνατόν. Αυτό θα εξοικονομήσει επίσης ενέργεια και θα μειώσει τις εκπομπές μεταφορών αν οι κατασκευαστές εγκαταστήσουν εργοστάσια κοντά σε πόλεις που αγοράζουν βαγόνια μετρό.
