Η αποστολή του Φίλσον ξεκίνησε στις 23 Μαΐου 1785, όταν αυτός και η παρέα του ξεκίνησαν από το Πίτσμπουργκ με μια βάρκα. Το keelboat ήταν ένα σκάφος με επίπεδο πυθμένα που χρησιμοποιούνταν συνήθως για τη μεταφορά αγαθών και ανθρώπων στα ποτάμια. Το πάρτι του Φίλσον ταξίδεψε στον ποταμό Οχάιο, σταματώντας σε διάφορα σημεία της διαδρομής για να κάνει παρατηρήσεις και να συλλέξει δείγματα.
Ένας από τους σημαντικότερους σταθμούς της αποστολής του Φίλσον ήταν στους Καταρράκτες του Οχάιο, μια σειρά ορμητικών ορμητικών νερών κοντά στο σημερινό Λούισβιλ του Κεντάκι. Οι Καταρράκτες του Οχάιο ήταν ένα σημαντικό εμπόδιο στη ναυσιπλοΐα στον ποταμό, και το κόμμα του Φίλσον έπρεπε να μεταφέρει το σκάφος του γύρω από τα ορμητικά νερά.
Αφού πέρασε τους Καταρράκτες του Οχάιο, το πάρτι του Φίλσον συνέχισε στον ποταμό. Σταμάτησαν σε πολλά χωριά των ιθαγενών της Αμερικής κατά μήκος του δρόμου και συνάντησαν επίσης μια σειρά από άγρια ζώα, όπως βουβάλους, άλκες και αρκούδες.
Η αποστολή του Φίλσον έφτασε στον ποταμό Μισισιπή στις 4 Ιουλίου 1785. Το κόμμα στη συνέχεια ταξίδεψε στον ποταμό Μισισιπή στο Natchez του Μισισιπή, όπου διαλύθηκαν.
Η αποστολή του Φίλσον στέφθηκε με επιτυχία. Αυτός και η παρέα του μπόρεσαν να ταξιδέψουν σε όλο το μήκος του ποταμού Οχάιο και να κάνουν πολύτιμες παρατηρήσεις σχετικά με τη φυσική ιστορία της περιοχής και τους γηγενείς κατοίκους. Το περιοδικό του Filson για την αποστολή δημοσιεύτηκε το 1784 και έγινε μια ευρέως διαβασμένη αφήγηση για την κοιλάδα του ποταμού Οχάιο.
