Ο ισπανικός αποικισμός της Κεντρικής Αμερικής ξεκίνησε στις αρχές του 16ου αιώνα, με την άφιξη κατακτητών όπως ο Hernán Cortés και ο Pedro de Alvarado. Οι Ισπανοί έθεσαν γρήγορα τον έλεγχο στην περιοχή και κυβέρνησαν την Κεντρική Αμερική για περισσότερα από 300 χρόνια.
Κατά τη διάρκεια της ισπανικής αποικιοκρατίας, η Κεντρική Αμερική χωρίστηκε σε πολλές επαρχίες, καθεμία από τις οποίες διοικούνταν από έναν Ισπανό κυβερνήτη. Οι επαρχίες ήταν:
* Κόστα Ρίκα
* Ελ Σαλβαδόρ
* Γουατεμάλα
* Ονδούρα
* Νικαράγουα
Οι Ισπανοί ίδρυσαν επίσης μια σειρά από ιεραποστολές στην Κεντρική Αμερική και εισήγαγαν τον Καθολικισμό στην περιοχή.
Η ισπανική αποικιακή περίοδος έληξε στις αρχές του 19ου αιώνα, με τους πολέμους της ανεξαρτησίας. Οι χώρες της Κεντρικής Αμερικής απέκτησαν την ανεξαρτησία τους από την Ισπανία το 1821 και σχημάτισαν την Ομοσπονδιακή Δημοκρατία της Κεντρικής Αμερικής. Η Ομοσπονδιακή Δημοκρατία διαλύθηκε το 1838 και οι χώρες της Κεντρικής Αμερικής έγιναν ανεξάρτητα έθνη.
