Πειρατές :Οι ισπανικοί στόλοι θησαυρών δέχονταν συχνά επίθεση από πειρατές. Αυτοί οι πειρατές ήταν συχνά Άγγλοι, Γάλλοι ή Ολλανδοί και λεηλάτησαν τα πλοία για το πολύτιμο φορτίο τους.
Καταιγίδες :Οι ισπανικοί στόλοι θησαυρών έπρεπε επίσης να αντιμετωπίσουν τις καταιγίδες. Ο Ατλαντικός Ωκεανός είναι ένας τεράστιος και απρόβλεπτος όγκος νερού και οι καταιγίδες θα μπορούσαν εύκολα να βλάψουν ή να βυθίσουν τα πλοία.
Ασθένεια :Η ασθένεια ήταν επίσης ένα σημαντικό πρόβλημα για τους ισπανικούς στόλους θησαυρών. Πολλοί από τους ναυτικούς πέθαναν από ασθένειες όπως η ευλογιά, η ιλαρά και ο κίτρινος πυρετός.
Ναυάγια :Τα ναυάγια ήταν επίσης συχνό φαινόμενο. Τα πλοία ήταν συχνά υπερφορτωμένα με θησαυρούς και δεν ήταν πάντα καλοφτιαγμένα. Ως αποτέλεσμα, θα μπορούσαν εύκολα να βυθιστούν σε καταιγίδες ή όταν χτυπούσαν υφάλους.
Οι Ισπανοί έλαβαν ορισμένα μέτρα για να προστατεύσουν τους στόλους των θησαυρών τους. Κατασκεύασαν οχυρά κατά μήκος της ακτής για να προστατεύουν τα πλοία καθώς φορτώνονταν και ξεφόρτωναν. Έστειλαν επίσης πολεμικά πλοία για να συνοδεύσουν τους στόλους των θησαυρών. Ωστόσο, αυτά τα μέτρα δεν ήταν πάντα αρκετά για να αποτρέψουν επιθέσεις πειρατών, καταιγίδες, ασθένειες ή ναυάγια.
