Το 1825, ο Φράνκλιν οδήγησε την πρώτη του Αρκτική αποστολή, η οποία εξερεύνησε τη βόρεια ακτή του Καναδά από τον ποταμό Μακένζι μέχρι τον ποταμό Κόπερμιν. Κατά τη διάρκεια αυτής της αποστολής, συναντήθηκε με τους Ινουίτ για πρώτη φορά. Ο Φράνκλιν εντυπωσιάστηκε από τη φιλοξενία, την ευφυΐα και τις ικανότητές τους να επιβιώνουν στο σκληρό αρκτικό περιβάλλον.
Το 1845, ο Φράνκλιν οδήγησε τη δεύτερη αποστολή του στην Αρκτική, η οποία χάθηκε στον πάγο με και τα 129 μέλη του πληρώματος. Η τύχη της αποστολής παρέμεινε άγνωστη για πολλά χρόνια, μέχρι που τελικά λύθηκε το 2014 όταν τα συντρίμμια του πλοίου του Φράνκλιν, HMS Erebus, βρέθηκαν στο στενό της Βικτώριας.
Παρά την τραγική έκβαση της δεύτερης αποστολής του, οι συναντήσεις του Φράνκλιν με τους Ινουίτ ήταν σημαντικά γεγονότα στην ιστορία της εξερεύνησης της Αρκτικής. Οι αλληλεπιδράσεις του με τους Ινουίτ βοήθησαν να διαλυθούν πολλοί από τους μύθους και τα στερεότυπα που είχαν οι Ευρωπαίοι για τους αυτόχθονες λαούς του Βορρά και έπαιξε ρόλο στη γεφύρωση του χάσματος μεταξύ των ευρωπαϊκών και των Ινουίτ πολιτισμών.
