Επέκταση των ορίων των Ηνωμένων Πολιτειών: Ο Τζέφερσον πίστευε στη σημασία της επέκτασης προς τα δυτικά και ήταν πρόθυμος να εξερευνήσει τις τεράστιες περιοχές που αποκτήθηκαν μέσω της Αγοράς της Λουιζιάνα. Ήθελε να δημιουργήσει μια ισχυρότερη αμερικανική παρουσία στην περιοχή και να αποκτήσει τον έλεγχο των εδαφών που διεκδικούσαν άλλες ευρωπαϊκές δυνάμεις.
Αναζήτηση οικονομικών ευκαιριών: Η αποστολή είχε ως στόχο τον εντοπισμό πιθανών οικονομικών πόρων και εμπορικών ευκαιριών στις αχαρτογράφητες περιοχές. Ο Τζέφερσον ήλπιζε να δημιουργήσει εμπορικούς δρόμους με τις αυτόχθονες φυλές και ενδεχομένως να βρει μια άμεση υδάτινη οδό προς τον Ειρηνικό Ωκεανό, που θα διευκόλυνε το εμπόριο με την Ασία.
Επιστημονική εξερεύνηση: Ο Τζέφερσον ήταν παθιασμένος με την επιστήμη και τη φυσική ιστορία. Ήθελε η αποστολή να συγκεντρώσει επιστημονικές γνώσεις για τη χλωρίδα, την πανίδα και τη γεωγραφία των δυτικών περιοχών. Ο Lewis και ο Clark έλαβαν οδηγίες να τεκμηριώσουν τα διάφορα είδη φυτών και ζώων, τη γεωλογία, το κλίμα και τους αυτόχθονες πολιτισμούς που συνάντησαν.
Διπλωματικές σχέσεις: Ο Τζέφερσον είδε επίσης την αποστολή ως ευκαιρία για τη σύναψη διπλωματικών σχέσεων με τις ιθαγενείς αμερικανικές φυλές στην περιοχή. Ήθελε να διαπραγματευτεί ειρηνικές συμφωνίες με αυτές τις φυλές και να εξασφαλίσει την υποστήριξή τους για την αμερικανική επέκταση.
Ενίσχυση της Εθνικής Ενότητας: Η αποστολή Lewis and Clark πραγματοποιήθηκε σε μια περίοδο αυξανόμενου εθνικισμού στις Ηνωμένες Πολιτείες. Ο Τζέφερσον ήλπιζε ότι αυτό το φιλόδοξο έργο θα ένωνε τη χώρα και θα έδειχνε τη δύναμη και τις ικανότητες του νέου έθνους.
Στέλνοντας την αποστολή Lewis and Clark στον Ειρηνικό Ωκεανό, ο Jefferson προσπάθησε να επιτύχει αρκετούς σημαντικούς στόχους, συμπεριλαμβανομένης της επέκτασης του αμερικανικού εδάφους, της εξερεύνησης νέων οικονομικών δυνατοτήτων, της απόκτησης επιστημονικής γνώσης, της δημιουργίας διπλωματικών σχέσεων και της ενίσχυσης της αίσθησης εθνικής υπερηφάνειας και ενότητας. Η επιτυχής ολοκλήρωση της αποστολής συνέβαλε σημαντικά στην ανάπτυξη και ανάπτυξη των Ηνωμένων Πολιτειών.
