Η Μαλαισία βιώνει δύο εποχές μουσώνων:τον νοτιοδυτικό μουσώνα και τον βορειοανατολικό μουσώνα. Ο νοτιοδυτικός μουσώνας εμφανίζεται από τον Μάιο έως τον Σεπτέμβριο, φέρνοντας έντονες βροχοπτώσεις στη δυτική ακτή της χερσονήσου της Μαλαισίας, καθώς και σε τμήματα του Sarawak και της Sabah. Ο βορειοανατολικός μουσώνας εμφανίζεται από τον Νοέμβριο έως τον Μάρτιο, επηρεάζοντας τη δυτική ακτή του Σαραβάκ και της Σαμπάχ. Κατά τη διάρκεια αυτών των εποχών των μουσώνων, οι ανατολικές ακτές της χερσονήσου της Μαλαισίας και του Sarawak θα έχουν ξηρότερο καιρό, ενώ η Sabah τείνει να είναι ξηρή και τις δύο εποχές.