Το Κιλκένι προέρχεται από τα Ιρλανδικά Cill Chainnigh, που σημαίνει «Εκκλησία του Cainneach» (Άγιος Κανίκης). Μια εκκλησία που ιδρύθηκε από τον Άγιο Κανίκη τον 6ο αιώνα έδωσε το όνομά της στην πόλη· η αγγλικημένη μορφή είναι Kilkenny.
