- Ποταμός Coco (Río Coco) :Αποτελεί μέρος των συνόρων με την Ονδούρα και είναι ο μεγαλύτερος ποταμός στη Νικαράγουα.
- Ποταμός Σαν Χουάν (Ρίο Σαν Χουάν) :Σχηματίζει τα σύνορα με την Κόστα Ρίκα και αποστραγγίζει τη λίμνη Νικαράγουα στην Καραϊβική Θάλασσα.
- Ποταμός Grande de Matagalpa (Río Grande de Matagalpa) :Διασχίζει το τμήμα Matagalpa.
- Ποταμός Prinzapolka (Río Prinzapolka) :Διασχίζει την Αυτόνομη Περιοχή ακτών της Βόρειας Καραϊβικής.
- Ποταμός Wawa (Río Wawa) :Διασχίζει την Αυτόνομη Περιοχή της Ακτής της Βόρειας Καραϊβικής και αποτελεί σημαντική πηγή υδροηλεκτρικής ενέργειας.
- Ποταμός Escondido (Río Escondido) :Διασχίζει την Αυτόνομη Περιφέρεια της Νότιας Ακτής της Καραϊβικής.
- Ποταμός Tuma (Río Tuma) :Διασχίζει τα διαμερίσματα Matagalpa και Boaco και αποτελεί σημαντική πηγή υδροηλεκτρικής ενέργειας.
- Ποταμός Chiquito (Río Chiquito) :Διασχίζει τα διαμερίσματα Matagalpa και Boaco.
- Ποταμός Τιπιτάπα (Ρίο Τιπιτάπα) :Ρέει από τη λίμνη Μανάγκουα στη λίμνη Νικαράγουα.
