Η διαφωνία για τα όρια προέκυψε λόγω της χρήσης ανακριβούς γλώσσας στη συνθήκη του 1825 μεταξύ Ρωσίας και Μεγάλης Βρετανίας, η οποία ανέφερε τα βουνά ως ορόσημα χωρίς να προσδιορίζει με σαφήνεια τη θέση τους. Η διαφωνία προέκυψε συγκεκριμένα για τον ορισμό των κορυφογραμμών των βουνών που επρόκειτο να ακολουθήσουν τα σύνορα. Οι Ηνωμένες Πολιτείες υποστήριξαν ότι το όριο πρέπει να ακολουθεί τις υψηλότερες κορυφές των βουνών της ακτής, ενώ ο Καναδάς ερμήνευσε τη συνθήκη ως τις κορυφές των βουνών Chilkat.
Αυτή η διαφωνία οδήγησε σε εντάσεις και αβεβαιότητα κατά μήκος των συνόρων, καθώς και οι δύο χώρες προσπάθησαν να ασκήσουν εξουσία και έλεγχο στις αμφισβητούμενες περιοχές. Η διαμάχη έθεσε προκλήσεις όσον αφορά τις οικονομικές δραστηριότητες, την εξερεύνηση πόρων και τη μετακίνηση ανθρώπων και αγαθών στην περιοχή.
Τελικά, το 1903, η διαφορά επιλύθηκε μέσω διαιτησίας από ένα δικαστήριο που ιδρύθηκε βάσει της Συνθήκης Hay-Herbert. Η απόφαση του δικαστηρίου ευνόησε σε μεγάλο βαθμό τη θέση των Ηνωμένων Πολιτειών, αναθέτοντας την πλειοψηφία της αμφισβητούμενης επικράτειας στις Ηνωμένες Πολιτείες, συμπεριλαμβανομένου του ελέγχου του λιμανιού Skagway, το οποίο ήταν απαραίτητο για την πρόσβαση σε κοιτάσματα χρυσού στην περιοχή Klondike.
Η επίλυση της Διαφωνίας των Συνόρων της Αλάσκας σηματοδότησε ένα σημαντικό βήμα για τη βελτίωση των διπλωματικών σχέσεων μεταξύ των Ηνωμένων Πολιτειών και του Καναδά και αποτέλεσε προηγούμενο για μελλοντικές διαπραγματεύσεις για τα σύνορα μεταξύ των δύο χωρών.
