Το χαρακτηριστικό λάσπι καφέ χρώμα του ποταμού Μισισιπί προκύπτει από τρεις κύριους παράγοντες:
Ταχύτητες ροής έως 10 mph ξεγουρνάνε τις όχθες, σηκώνοντας τεράστιες ποσότητες ιλύ στη στήλη νερού.
Το ποτάμι διασχίζει περιοχές πλούσιες σε λεπτόστρωμα αργίλο και ιλύ, που παραμένουν αιωρούμενα για μεγάλες αποστάσεις, ενώ το πιο γρανώδες άμμος καθίζει γρήγορα.
Αλγές, βακτήρια και πρωτοζώα ευδοκιμούν στο θρεπτικό νερό· τα μεταβολικά τους υποπροϊόντα προσθέτουν στη θολερότητα.
Μαζί, αυτοί οι παράγοντες κάνουν τον Μισισιπί έναν από τους πιο λάσπι ποταμούς του κόσμου, επηρεάζοντας πλοήγηση, επεξεργασία νερού και υδατικά οικοσυστήματα.