- Φυσικά εμπόδια: Η διαδρομή του καναλιού διέσχιζε ποικίλα δύσκολα εδάφη, όπως βάλτους, δάση και λόφους. Οι εργάτες έπρεπε να σκάψουν ή να χτίσουν πάνω από αυτά τα εμπόδια, τα οποία απαιτούσαν πολύ χρόνο και προσπάθεια.
- Ανεπαρκείς οικονομικοί πόροι: Το κόστος κατασκευής του καναλιού ήταν τεράστιο και η πολιτεία της Νέας Υόρκης είχε συχνά έλλειψη κεφαλαίων. Αυτό σήμαινε ότι οι εργαζόμενοι συχνά αμείβονταν καθυστερημένα ή καθόλου, γεγονός που καθιστούσε δύσκολη την προσέλκυση και τη διατήρηση ενός αξιόπιστου εργατικού δυναμικού.
- Ασθένεια: Η περιοχή κατασκευής του καναλιού ήταν πρόσφορο έδαφος για ασθένειες, όπως ελονοσία, κίτρινο πυρετό και δυσεντερία. Χιλιάδες εργαζόμενοι πέθαναν από αυτές τις ασθένειες, γεγονός που δυσκόλεψε τη διατήρηση του έργου εντός του χρονοδιαγράμματος.
- Πολιτική αντιπολίτευση: Το έργο του καναλιού δεν ήταν παγκοσμίως δημοφιλές και υπήρχε σημαντική αντίθεση σε αυτό από διάφορες ομάδες, συμπεριλαμβανομένων ιδιοκτητών γης, εμπόρων και πολιτικών. Αυτή η αντίθεση κατέστησε δύσκολη την εξασφάλιση χρηματοδότησης και υποστήριξης για το έργο.
Παρά όλες αυτές τις προκλήσεις, το κανάλι Erie ολοκληρώθηκε τελικά το 1825 και γνώρισε μεγάλη επιτυχία. Το κανάλι βοήθησε στο άνοιγμα της Δύσης στον εποικισμό και το εμπόριο, και έπαιξε ζωτικό ρόλο στην ανάπτυξη των Ηνωμένων Πολιτειών.