Το Γουισκόνσιν διαθέτει ungefähρ 2.000 μίλια (3.219 χλμ) καναλιών, ένα από τα πιο εκτεταμένα τεχνητά δίκτυα υδατοδρομίων στις Ηνωμένες Πολιτείες. Αυτοί οι κανάλιοι, πολλοί από τους οποίους χρονολογούνται από τον 19ο αιώνα, χτίστηκαν για μεταφορές, ξυλοτομία, αποξήρανση και αργότερα για αναψυχή. Το Υδατόδρομιο Φοξ–Γουισκόνσιν και ο Κανάλιος Μιλγουόκι είναι ιστορικά παραδείγματα. Σήμερα, πολλά τμήματα υποστηρίζουν ναυτιλία, αλιεία και βιότοπους άγριας ζωής, ενώ άλλα έχουν αναδιαμορφωθεί σε μονοπάτια.