Το Μεγάλο Μήλο μοιράζεται με το Λονδίνο τη διάκριση του να έχει ένα πραγματικά διάσημο σύστημα δημόσιων μεταφορών, με το μετρό της Νέας Υόρκης να χρησιμοποιείται σαν σετ σε ταινίες από καιρόν τώρα. Ωστόσο, υπάρχουν περισσότερα από το μετρό στα δημόσια μέσα μεταφοράς της Νέας Υόρκης. Μια πυκνά πληθυσμένη παλιά πόλη της Ανατολικής Ακτής που έλκει μεταβατικά εργαζόμενους από μερικές δεκάδες μίλια προς όλες τις κατευθύνσεις, η πόλη βρίσκεται στο κέντρο ενός τεράστιου σιδηροδρομικού και λεωφορειακού δικτύου.
Ο σημαντικότερος διοικητικός οργανισμός για τη Νέα Υόρκη είναι η Metropolitan Transit Authority, ή MTA. Αυτός ο οργανισμός είναι μια οργάνωση της Πολιτείας της Νέας Υόρκης, οπότε δεν διαχειρίζεται από το Δημαρχείο. Διαχειρίζεται τις δημόσιες μεταφορές στους πέντε δήμους της Νέας Υόρκης και τους περιφερειακούς νομούς Dutchess, Nassau, Orange, Putnam, Rockland, Suffolk και Westchester. Είναι σημαντικό να σημειωθεί ότι οι δημόσιες μεταφορές στο New Jersey και Connecticut, που είναι σημαντικές για τους εργαζόμενους που μεταβαίνουν στη Νέα Υόρκη, βρίσκονται έξω από την αρμοδιότητα του MTA.
Το σύστημα μετρό της Νέας Υόρκης είναι το μεγαλύτερο σύστημα της κατηγορίας του ως προς μήκος ραγδαίων. Όσον αφορά την επιβατική κίνηση, κατατάσσεται τέταρτο στον κόσμο. Μια κανονική ημέρα, περίπου 5 εκατομμύρια επιβάτες χρησιμοποιούν το μετρό, με το τρέχον ρεκόρ να σταθεί στα 7,5 εκατομμύρια επιβάτες σε μία ημέρα. Το μετρό εκτείνεται σε τέσσερις από τους πέντε δήμους της πόλης (το Στάτεν Άιλαντ δεν έχει μετρό).
Η υπηρεσία λεωφορείων του MTA λειτουργεί με περισσότερες από 5.800 λεωφορεία σε 230 διαδρομές, μεταφέροντας λίγο περισσότερους από 2 εκατομμύρια επιβάτες την ημέρα. Εξυπηρετούν όλους τους πέντε δήμους. Τα λεωφορεία αναγνωρίζονται από έναν κωδικό γράμμα-αριθμό. Ο αριθμός προσδιορίζει τη διαδρομή, και το γράμμα την κύρια πόλη του λεωφορείου, ή αν είναι express. Το «X» σημαίνει «Express», το «B» για «Brooklyn», το «Bx» για «Bronx», το «M» για «Manhattan», το «Q» για «Queens» και το «S» για «Staten Island». Το «M104», για παράδειγμα, θα ήταν «Διαδρομή 104 Μανχάτεν».
Το Staten Island Ferry είναι το πιο φιλόδοξο πλοίο στην Αμερική. Πλοηγούμενη στα 5 μίλια νερού μεταξύ Μανχάτεν και Στάτεν Άιλαντ, το πλοίο λειτουργεί με 5 πλοία που μεταφέρουν μεταξύ 65.000 και 70.000 επιβατών κάθε ημέρα. Το πλοίο τρέχει από την πόλη, όχι από το MTA.
Υπάρχουν δύο υπηρεσίες AirTrain που μεταφέρουν επιβάτες στους διεθνείς αεροδρόμους John F. Kennedy και Newark. Και οι δύο λειτουργούν από ιδιωτικές εταιρείες, αλλά υπό σύμβαση με την Port Authority of New York and New Jersey.
Το Port Authority Trans-Hudson Train (PATH Train) συνδέει το Μανχάτεν με το New Jersey, με στάσεις στο Jersey City, Hoboken, Harrison και Newark. Μεταφέρει σχεδόν 1/4 εκατομμύριο μεταβατικούς κάθε ημέρα.
