Η έρημος Namib ψύχεται από τα κρύα νερά του Ατλαντικού Ωκεανού, γεγονός που βοηθά στη διατήρηση των θερμοκρασιών σχετικά ήπιων. Η μέση θερμοκρασία στην έρημο Ναμίμπ είναι περίπου 20 βαθμοί Κελσίου (68 βαθμοί Φαρενάιτ). Αντίθετα, η έρημος Kgalagadi βρίσκεται πιο μέσα στην ενδοχώρα, και δεν έχει το όφελος από τις δροσερές επιπτώσεις του ωκεανού. Ως αποτέλεσμα, οι θερμοκρασίες στην έρημο Kgalagadi μπορεί να είναι πολύ υψηλότερες, με τις μέσες θερμοκρασίες να φτάνουν έως και τους 30 βαθμούς Κελσίου (86 βαθμούς Φαρενάιτ).
Γενικά, η έρημος Namib είναι πιο δροσερή από την έρημο Kgalagadi λόγω της εγγύτητάς της στον Ατλαντικό Ωκεανό. Ωστόσο, μπορεί να υπάρξει κάποια διακύμανση στις θερμοκρασίες μεταξύ των δύο ερήμων, ανάλογα με την εποχή του χρόνου και τη συγκεκριμένη τοποθεσία.
